More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0557 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
377 aa  766    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  73.94 
 
 
378 aa  547  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  42.56 
 
 
383 aa  267  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
369 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
367 aa  205  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.89 
 
 
385 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
362 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
376 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  34.93 
 
 
382 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  32.98 
 
 
404 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
377 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 
376 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  35.27 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  35.27 
 
 
381 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
370 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
389 aa  159  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
367 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  35.71 
 
 
638 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.87 
 
 
369 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.79 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  29.37 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
385 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
376 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
613 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
378 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
413 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
377 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
419 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
419 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
360 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
417 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  31.17 
 
 
403 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
410 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
750 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
397 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
402 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.8 
 
 
650 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  39.36 
 
 
770 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
398 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
390 aa  97.4  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
387 aa  96.3  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
391 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  28.51 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.82 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.25 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
376 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
365 aa  94  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
398 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  27.33 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 
419 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 
386 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
378 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  28.05 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  37.99 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
410 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
405 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 
370 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
395 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
405 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  36.9 
 
 
422 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0088  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.323047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
414 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
411 aa  89.4  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
420 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  32.32 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.63 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>