More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0400 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
446 aa  909    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  99.1 
 
 
446 aa  902    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3200  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.69 
 
 
446 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421836  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1276  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.79 
 
 
450 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2708  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.06 
 
 
447 aa  608  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0287014  decreased coverage  0.0000651143 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1244  nucleotide sugar dehydrogenase  67.34 
 
 
450 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  65.61 
 
 
442 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27790  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.36 
 
 
440 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  65.38 
 
 
443 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2616  nucleotide sugar dehydrogenase  66.37 
 
 
449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2077  nucleotide sugar dehydrogenase  64.29 
 
 
448 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1968  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.29 
 
 
448 aa  599  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.250179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2330  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  64.29 
 
 
448 aa  599  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0299492  normal  0.148756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  64.55 
 
 
446 aa  601  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2015  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.48 
 
 
463 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1236  nucleotide sugar dehydrogenase  64.4 
 
 
448 aa  596  1e-169  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.038693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.78 
 
 
448 aa  592  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.75 
 
 
447 aa  589  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.53 
 
 
447 aa  587  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2817  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.5 
 
 
446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29960  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase protein  64.55 
 
 
440 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2236  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.33 
 
 
452 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  63.49 
 
 
450 aa  579  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1003  nucleotide sugar dehydrogenase  61.22 
 
 
445 aa  578  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1280  nucleotide sugar dehydrogenase  61.45 
 
 
445 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000077614  normal  0.824571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  61.68 
 
 
447 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  63.33 
 
 
440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.32 
 
 
444 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.86 
 
 
445 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4070  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.27 
 
 
449 aa  566  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.476098  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1761  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.19 
 
 
446 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385474  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1405  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.64 
 
 
440 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01224  UDP-glucose dehydrogenase  67.75 
 
 
407 aa  559  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0873171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  59.41 
 
 
445 aa  560  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.73 
 
 
450 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.36 
 
 
458 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.875801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1343  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.91 
 
 
440 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1502  nucleotide sugar dehydrogenase  58.28 
 
 
445 aa  550  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.239103  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2848  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 
459 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1586  putative nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 
464 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18300  putative nucleotide sugar dehydrogenase  59.91 
 
 
464 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1284  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  60.91 
 
 
439 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.583067 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2891  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59 
 
 
464 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0166748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.72 
 
 
457 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2766  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.44 
 
 
442 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.412534  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0821  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  57.63 
 
 
445 aa  535  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  59.42 
 
 
454 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2926  UDP-glucose dehydrogenase, putative  60.44 
 
 
442 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0731315  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2696  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.54 
 
 
464 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108367  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2846  nucleotide sugar dehydrogenase  59.95 
 
 
445 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  59.2 
 
 
454 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2253  nucleotide sugar dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4164  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.82 
 
 
442 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.9 
 
 
467 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  57.93 
 
 
457 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1010  nucleotide sugar dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0727492  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0572  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0931  nucleotide sugar dehydrogenase  59.09 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.87 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1051  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.56 
 
 
466 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.31 
 
 
457 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  58.76 
 
 
473 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.5 
 
 
470 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.76 
 
 
473 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  58.72 
 
 
470 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0578  nucleotide sugar dehydrogenase  58.06 
 
 
453 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.76 
 
 
473 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  58.24 
 
 
467 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1305  nucleotide sugar dehydrogenase  58.19 
 
 
454 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.80175  hitchhiker  0.0000457117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  57.73 
 
 
470 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  58.06 
 
 
470 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1058  nucleotide sugar dehydrogenase  57.14 
 
 
476 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.29 
 
 
466 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.98 
 
 
482 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1072  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.91 
 
 
457 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  59 
 
 
440 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.5 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.5 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  58.5 
 
 
470 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0503  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.86 
 
 
454 aa  518  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.3 
 
 
466 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.78 
 
 
473 aa  521  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  54.44 
 
 
440 aa  521  1e-146  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.06 
 
 
470 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.3 
 
 
466 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.17 
 
 
453 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.87 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.87 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.87 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.87 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1223  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.25 
 
 
445 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000260089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  56.1 
 
 
482 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.31 
 
 
442 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0463  nucleotide sugar dehydrogenase subfamily protein  54.57 
 
 
440 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1257  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.96 
 
 
445 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.98 
 
 
450 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5105  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.18 
 
 
449 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1806  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.76 
 
 
467 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>