More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0389 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0389  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
121 aa  234  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0397  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
121 aa  234  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.203848  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0617  50S ribosomal protein L18  92.56 
 
 
121 aa  221  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130788  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4227  50S ribosomal protein L18  93.39 
 
 
121 aa  220  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0059454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0336  50S ribosomal protein L18  90.91 
 
 
121 aa  217  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0037548  hitchhiker  0.00117224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0491  50S ribosomal protein L18  90.91 
 
 
121 aa  216  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0139014  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5054  50S ribosomal protein L18  89.26 
 
 
122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00315198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1038  50S ribosomal protein L18  89.26 
 
 
121 aa  211  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00219408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2309  50S ribosomal protein L18  90.91 
 
 
121 aa  194  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0354463  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3933  50S ribosomal protein L18  81.82 
 
 
121 aa  189  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3427  50S ribosomal protein L18  78.51 
 
 
121 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.190409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3003  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 
118 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0984872  normal  0.0535953 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2934  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 
118 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.431392  hitchhiker  0.000000945815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3281  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 
118 aa  174  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000101647  hitchhiker  0.0000625516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2823  50S ribosomal protein L18  73.55 
 
 
121 aa  167  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0449582  normal  0.246581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0330  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0191995  decreased coverage  0.00330541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2616  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1940  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3760  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00916301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3153  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0233073  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3052  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00599217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0265  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00184574  hitchhiker  0.00751382 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3788  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3494  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.463785  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3730  50S ribosomal protein L18  72.73 
 
 
121 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000891962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3628  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000201917  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3463  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00117262  normal  0.0353993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0292  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000486203  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2743  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0283  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0906703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0364  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000939296  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0343  50S ribosomal protein L18  71.9 
 
 
121 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340572  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3301  50S ribosomal protein L18  71.07 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148876  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3322  50S ribosomal protein L18  65 
 
 
117 aa  150  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000880137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0335  50S ribosomal protein L18  64.46 
 
 
118 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304847  unclonable  0.0000000454999 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3163  50S ribosomal protein L18  73.33 
 
 
118 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00625996  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0783  ribosomal protein L18  61.98 
 
 
118 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000107746  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0311  ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  144  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00282815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0295  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 
117 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000164906  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0735  ribosomal protein L18  57.5 
 
 
115 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0002396  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0505  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000721211  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0500  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000674494  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0772  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  134  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.638388  normal  0.012276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
116 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04504  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
119 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673327  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0442  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 
116 aa  131  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110034  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2356  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0069  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0150705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0842  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2308  ribosomal protein L18  56.67 
 
 
117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000272436  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 
117 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 
117 aa  124  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0437  50S ribosomal protein L18  61.98 
 
 
116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0352057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0975  50S ribosomal protein L18  61.16 
 
 
116 aa  124  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000749489  hitchhiker  0.000035288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0066  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
117 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000122538  hitchhiker  0.000000000000207264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0510  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
119 aa  124  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.574759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0449  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
119 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.540056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0421  50S ribosomal protein L18P  57.5 
 
 
117 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0951121  normal  0.234114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0474  50S ribosomal protein L18  59.62 
 
 
117 aa  120  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2308  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 
117 aa  120  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4733  50S ribosomal protein L18  65.31 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000341621  normal  0.608579 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0470  50S ribosomal protein L18  65.31 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000372207  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0500  50S ribosomal protein L18  65.31 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000118078  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0503  50S ribosomal protein L18  65.31 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824638  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0642  ribosomal protein L18  64.29 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00442268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4532  50S ribosomal protein L18  64.29 
 
 
116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00621491  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2153  ribosomal protein L18  58.33 
 
 
116 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438386  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1005  50S ribosomal protein L18  58.65 
 
 
117 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00185966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00954  50S ribosomal protein L18  63.54 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.177845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09010  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
116 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00133573  normal  0.174484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0853  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
116 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.069304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5063  50S ribosomal protein L18  62.24 
 
 
116 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136187  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3893  50S ribosomal protein L18  63.54 
 
 
116 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000259754  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0076  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
117 aa  111  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0482673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4260  ribosomal protein L18  60.33 
 
 
116 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000795292  unclonable  0.00000000000239717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0617  ribosomal protein L18  57.28 
 
 
117 aa  110  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0344  ribosomal protein L18  50.83 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.09321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3508  ribosomal protein L18  55 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000880672  hitchhiker  0.0000000983533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3985  50S ribosomal protein L18  54.81 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0808735  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0299  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 
117 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000242557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0599  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 
117 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000089079  normal  0.874804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3898  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 
117 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427886  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3806  50S ribosomal protein L18  54.81 
 
 
117 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000406006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  49.19 
 
 
121 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  50.43 
 
 
120 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0353  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 
117 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1838  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 
117 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  56.7 
 
 
121 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 
120 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0336  50S ribosomal protein L18  57.29 
 
 
117 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000887363  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  53.61 
 
 
121 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0410  50S ribosomal protein L18  45.08 
 
 
119 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0385  50S ribosomal protein L18  45.08 
 
 
119 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4674  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
116 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000567326  unclonable  0.00000000872003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 
120 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  48.78 
 
 
120 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001726  LSU ribosomal protein L18p (L5e)  53.47 
 
 
117 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000014236  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  45.53 
 
 
120 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>