More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0382 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  72.37 
 
 
533 aa  734  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  8.58537e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
532 aa  1066  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  8.68135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  75.14 
 
 
529 aa  763  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  76.62 
 
 
540 aa  734  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  69.66 
 
 
528 aa  691  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.74141e-05  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  72.13 
 
 
566 aa  753  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  99.62 
 
 
532 aa  1062  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  55.68 
 
 
534 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  56.23 
 
 
546 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.68 
 
 
525 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  51.26 
 
 
530 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  51.81 
 
 
516 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  53.1 
 
 
519 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 
524 aa  470  1e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 
525 aa  445  1e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 
518 aa  439  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  51.24 
 
 
543 aa  438  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  47.34 
 
 
536 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  46.87 
 
 
519 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  49.81 
 
 
517 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
519 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  40.39 
 
 
520 aa  405  1e-112  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 
520 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  44.28 
 
 
532 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 
531 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 
539 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
546 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  42.59 
 
 
545 aa  356  6e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  43.45 
 
 
602 aa  343  6e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 
537 aa  340  3e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  41.1 
 
 
537 aa  337  3e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 
542 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  37.77 
 
 
700 aa  332  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
548 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 
552 aa  323  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.57 
 
 
640 aa  320  4e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  39.78 
 
 
798 aa  315  1e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  40.19 
 
 
668 aa  308  2e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 
543 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.5 
 
 
585 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 
582 aa  287  3e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  38.45 
 
 
579 aa  283  7e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  37.01 
 
 
603 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
579 aa  281  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
600 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 
578 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
573 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.67 
 
 
591 aa  280  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
581 aa  280  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
583 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 
579 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  38.7 
 
 
569 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  39.33 
 
 
525 aa  276  6e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 
562 aa  275  1e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
573 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.61 
 
 
587 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.85 
 
 
605 aa  271  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 
582 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  40.23 
 
 
595 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  37.77 
 
 
582 aa  270  3e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.49 
 
 
567 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  37.15 
 
 
582 aa  269  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  38.36 
 
 
577 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 
584 aa  267  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  39.28 
 
 
575 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 
576 aa  266  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
593 aa  266  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
574 aa  266  9e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 
568 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 
581 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
567 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 
579 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 
579 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  37.39 
 
 
579 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 
572 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
583 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
560 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
559 aa  260  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  38.3 
 
 
585 aa  260  5e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 
546 aa  259  9e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  38.91 
 
 
557 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  37.55 
 
 
559 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 
585 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
554 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.6 
 
 
529 aa  256  8e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  33.01 
 
 
543 aa  253  5e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 
603 aa  253  8e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 
582 aa  253  8e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
552 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
567 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 
639 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.86 
 
 
573 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.54105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.86 
 
 
557 aa  249  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.79 
 
 
554 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.23 
 
 
557 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 
583 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  37.55 
 
 
559 aa  247  5e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.47 
 
 
560 aa  247  5e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.04459e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  37.47 
 
 
560 aa  246  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.05869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
560 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.05669e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>