218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0339 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  78.74 
 
 
426 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  82.28 
 
 
441 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  99.52 
 
 
440 aa  837    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  74.82 
 
 
430 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  100 
 
 
437 aa  889    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  65.44 
 
 
468 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  70.12 
 
 
413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  63.54 
 
 
471 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  69.74 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  57.28 
 
 
440 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  47.53 
 
 
432 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  47.53 
 
 
432 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  48 
 
 
425 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  50.77 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  46.76 
 
 
430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  46.39 
 
 
417 aa  362  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  50.26 
 
 
430 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  45.48 
 
 
433 aa  360  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  46.15 
 
 
434 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  47.17 
 
 
432 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  47.17 
 
 
433 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  46.37 
 
 
434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  46.37 
 
 
434 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  45.73 
 
 
419 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2739  hypothetical protein  44.14 
 
 
471 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895962  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2568  putative RNA methylase  45.36 
 
 
472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.509771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2978  putative RNA methylase  45.57 
 
 
472 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  39.96 
 
 
485 aa  325  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  39.38 
 
 
480 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  44.5 
 
 
387 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0147  N6-adenine-specific DNA methylase-like protein  58.01 
 
 
779 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  39.91 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  40 
 
 
385 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  39.48 
 
 
380 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  39.28 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  37.28 
 
 
375 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  37.84 
 
 
376 aa  259  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  37.35 
 
 
376 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.99 
 
 
749 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.88 
 
 
708 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.28 
 
 
711 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  36.39 
 
 
393 aa  243  7e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  36.36 
 
 
389 aa  242  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.72 
 
 
711 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  36.48 
 
 
391 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.66 
 
 
712 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.05 
 
 
711 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.01 
 
 
709 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.01 
 
 
709 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.01 
 
 
709 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.81 
 
 
713 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.81 
 
 
713 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.81 
 
 
713 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.01 
 
 
709 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.29 
 
 
709 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34 
 
 
711 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.75 
 
 
711 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  33.75 
 
 
393 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.21 
 
 
713 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.02 
 
 
711 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  36.21 
 
 
387 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.26 
 
 
752 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.85 
 
 
701 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.67 
 
 
718 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.05 
 
 
715 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0401  putative RNA methylase  34.48 
 
 
387 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.04 
 
 
725 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  35.15 
 
 
729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  34.69 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0023  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.41 
 
 
707 aa  213  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.47 
 
 
738 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.2 
 
 
705 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  32.84 
 
 
380 aa  210  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.36 
 
 
730 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  32.43 
 
 
762 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0022  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.93 
 
 
707 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
707 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.13 
 
 
705 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.2 
 
 
718 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.12 
 
 
730 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.93 
 
 
705 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  35.96 
 
 
387 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.12 
 
 
730 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.19 
 
 
750 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.12 
 
 
730 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  35.96 
 
 
387 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.34 
 
 
699 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.21 
 
 
708 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  30.67 
 
 
375 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  30.67 
 
 
375 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  32.67 
 
 
375 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  31.07 
 
 
395 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.15 
 
 
725 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  35.38 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>