More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0336 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  100 
 
 
255 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  497  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  91.8 
 
 
263 aa  447  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  89.39 
 
 
262 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  86.35 
 
 
256 aa  420  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  83.27 
 
 
264 aa  414  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  84.49 
 
 
268 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  81.93 
 
 
264 aa  400  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  80.72 
 
 
265 aa  400  1e-110  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  76.73 
 
 
251 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  75.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  71.84 
 
 
261 aa  363  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  71.84 
 
 
258 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  71.14 
 
 
258 aa  361  7e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  71.14 
 
 
258 aa  361  7e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  71.14 
 
 
258 aa  361  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  71.14 
 
 
258 aa  359  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  71.54 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  72.24 
 
 
263 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  71.02 
 
 
260 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  70.61 
 
 
261 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  73.22 
 
 
266 aa  358  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  70.28 
 
 
255 aa  358  6e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  70.33 
 
 
258 aa  356  2e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 
262 aa  355  4e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  70.04 
 
 
258 aa  355  4e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  70.33 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  70.2 
 
 
262 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  70.2 
 
 
262 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  71.19 
 
 
255 aa  351  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  69.2 
 
 
244 aa  345  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  68.57 
 
 
268 aa  338  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  67.89 
 
 
240 aa  318  4e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  62.96 
 
 
241 aa  315  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  62.2 
 
 
240 aa  313  1e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  64.2 
 
 
247 aa  313  2e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  62.9 
 
 
310 aa  312  4e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  61.32 
 
 
241 aa  312  4e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  64.11 
 
 
321 aa  312  4e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  61.73 
 
 
241 aa  310  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  60.91 
 
 
241 aa  308  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  60.89 
 
 
240 aa  306  2e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  63.87 
 
 
258 aa  305  4e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  63.87 
 
 
258 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  303  2e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  63.64 
 
 
282 aa  303  2e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  303  2e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  62.55 
 
 
243 aa  303  2e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 
336 aa  303  2e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  58.13 
 
 
241 aa  303  2e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.25 
 
 
241 aa  302  3e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  61.13 
 
 
243 aa  302  4e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  60.57 
 
 
316 aa  301  5e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  301  5e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  301  5e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  301  5e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  65.55 
 
 
261 aa  301  5e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  301  5e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  60.91 
 
 
241 aa  301  7e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  61.32 
 
 
317 aa  301  8e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 
243 aa  301  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.76 
 
 
241 aa  300  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  61.73 
 
 
243 aa  299  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  62.14 
 
 
239 aa  298  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  61.38 
 
 
241 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  62.76 
 
 
268 aa  298  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  60.74 
 
 
317 aa  297  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  62.14 
 
 
243 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91993e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  61.32 
 
 
243 aa  298  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02228  ABC transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 
239 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.622323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  63.64 
 
 
282 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  61.63 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 
264 aa  297  1e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  61.54 
 
 
256 aa  296  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  60.91 
 
 
314 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  59.68 
 
 
241 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 
249 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 
277 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  63.03 
 
 
270 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  61.16 
 
 
332 aa  296  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 
249 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.94 
 
 
241 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  61.73 
 
 
254 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  58.54 
 
 
241 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  60.74 
 
 
333 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  61.32 
 
 
279 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  62.96 
 
 
241 aa  295  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.94 
 
 
241 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.32 
 
 
241 aa  295  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0671  ABC transporter related  60.91 
 
 
240 aa  295  5e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.54 
 
 
241 aa  295  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  61.76 
 
 
289 aa  294  8e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  61.76 
 
 
289 aa  294  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>