More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0258 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
517 aa  995    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  97.87 
 
 
517 aa  887    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  60.46 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  61.16 
 
 
480 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0323  Fis family transcriptional regulator  64.65 
 
 
556 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.362622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3491  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  61.54 
 
 
493 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  59.96 
 
 
483 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.4 
 
 
509 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.4 
 
 
509 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  49.2 
 
 
491 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  43.84 
 
 
519 aa  356  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  47.39 
 
 
489 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.98 
 
 
502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  46.39 
 
 
514 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.31 
 
 
502 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  40.13 
 
 
502 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.92 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.92 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0860  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.03 
 
 
490 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  38.98 
 
 
533 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.44 
 
 
490 aa  309  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  40.09 
 
 
502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  41.91 
 
 
504 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.7 
 
 
502 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.39 
 
 
527 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.92 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.52 
 
 
498 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.01 
 
 
515 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.83 
 
 
514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  39.83 
 
 
493 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  39.83 
 
 
498 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
514 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
498 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
498 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
498 aa  302  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
498 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.66 
 
 
498 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40.25 
 
 
504 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.51 
 
 
515 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.9 
 
 
699 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  39.32 
 
 
514 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.45 
 
 
604 aa  274  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  37.14 
 
 
496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  39.15 
 
 
505 aa  273  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  36.5 
 
 
483 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.25 
 
 
489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  41.93 
 
 
475 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.77 
 
 
474 aa  263  8e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  37.81 
 
 
496 aa  263  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.18 
 
 
702 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.37 
 
 
601 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  38.92 
 
 
490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
593 aa  259  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
582 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
582 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
576 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
615 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  38.77 
 
 
594 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  38.77 
 
 
585 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  38.81 
 
 
492 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.41 
 
 
525 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.19 
 
 
529 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.08 
 
 
482 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
552 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.82 
 
 
509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.56 
 
 
543 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.91 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.82 
 
 
509 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.91 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.15 
 
 
499 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.61 
 
 
509 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.81 
 
 
498 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0938  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  37.34 
 
 
499 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.04 
 
 
515 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1217  outer membrane efflux protein  39.02 
 
 
498 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.538027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  36.02 
 
 
504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.77 
 
 
487 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1045  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  38.81 
 
 
494 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.44263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.21 
 
 
488 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268118  normal  0.678051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1020  putative multidrug resistance protein  35.31 
 
 
484 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.2 
 
 
509 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  35.08 
 
 
483 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.75 
 
 
475 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.34 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  35.88 
 
 
471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.62 
 
 
470 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.9 
 
 
516 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.78 
 
 
499 aa  206  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05506  putative outer-membrane drug efflux protein  36.53 
 
 
508 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.9 
 
 
478 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.9 
 
 
478 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.9 
 
 
478 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.9 
 
 
478 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  33.62 
 
 
488 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  36.28 
 
 
476 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  30.9 
 
 
478 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
492 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.68 
 
 
500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.42 
 
 
493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
504 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>