More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0152 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0152  porin Gram-negative type  100 
 
 		 326 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0134  porin  97.84 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  72.13 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  33.24 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.58 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  34.56 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  27.98 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.54 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.86 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.81 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  29.2 
 
 		 327 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  29.41 
 
 		 352 aa  92.4  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1258  porin  28.28 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  28.33 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.03 
 
 		 363 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  29.36 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  30.23 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  27.78 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  27.78 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  28.92 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  30.3 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  29.81 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.71 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  30.7 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  28.92 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  29.88 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.38 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.14 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  27.8 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  28.61 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  29.52 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  28.86 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  30.03 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  27.51 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 358 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  28.86 
 
 		 449 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  29.04 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.91 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.22 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  29.49 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  26.65 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3413  outer membrane porin  27.95 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000336209 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  28.28 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.18 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  29.41 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  28.67 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.33 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  31.41 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  28.29 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  27.93 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  27.36 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  28.13 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  28.05 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  28.3 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  28.29 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  27.02 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  27.24 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  26.48 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  28.27 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  28.67 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.46 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  28.49 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  27.53 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  29.91 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  28.05 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  27.57 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  26.81 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  29.72 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  27.12 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  30.06 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  28.13 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  27.47 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  28.78 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.65 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  28.07 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  28.33 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  25.98 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  27.58 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  26.74 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  27.58 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  30.43 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  25.78 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  28.65 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  31.95 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  27.82 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6718  porin  30.03 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.457172 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6483  porin  30.03 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  28.33 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>