More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0103 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.11 
 
 		 711 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.98 
 
 		 617 aa  677    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  68.72 
 
 		 595 aa  776    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.15 
 
 		 612 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.14 
 
 		 719 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  61.55 
 
 		 637 aa  738    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.62 
 
 		 659 aa  781    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  54.63 
 
 		 600 aa  643    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.89 
 
 		 625 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.17 
 
 		 601 aa  671    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.13 
 
 		 636 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.98 
 
 		 617 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.8 
 
 		 615 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.26 
 
 		 598 aa  705    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.77 
 
 		 693 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 647 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 763 aa  727    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 623 aa  1270    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.49 
 
 		 615 aa  719    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.13 
 
 		 615 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.54 
 
 		 616 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.36 
 
 		 613 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.29 
 
 		 644 aa  723    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  58.25 
 
 		 618 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.38 
 
 		 626 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 658 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  73.14 
 
 		 618 aa  918    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.43 
 
 		 611 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.43 
 
 		 611 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  71.82 
 
 		 633 aa  893    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.17 
 
 		 615 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.17 
 
 		 615 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.7 
 
 		 623 aa  1185    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.46 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.83 
 
 		 619 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.65 
 
 		 630 aa  708    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.24 
 
 		 598 aa  683    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.4 
 
 		 662 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.29 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.44 
 
 		 616 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.82 
 
 		 607 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.71 
 
 		 714 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  77.6 
 
 		 677 aa  1006    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  70.55 
 
 		 639 aa  875    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.31 
 
 		 600 aa  640    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.29 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.26 
 
 		 611 aa  656    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.39 
 
 		 622 aa  977    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  57.72 
 
 		 628 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.06 
 
 		 637 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.13 
 
 		 615 aa  724    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.85 
 
 		 625 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.29 
 
 		 615 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.1 
 
 		 615 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  78.48 
 
 		 633 aa  995    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.51 
 
 		 657 aa  703    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.63 
 
 		 606 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.93 
 
 		 625 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.85 
 
 		 705 aa  1083    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.05 
 
 		 607 aa  632  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.18 
 
 		 709 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.6 
 
 		 605 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.53 
 
 		 609 aa  628  1e-179  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.06 
 
 		 715 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  53.29 
 
 		 709 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.71 
 
 		 715 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.96 
 
 		 712 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.9 
 
 		 715 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.89 
 
 		 711 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.97 
 
 		 709 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.44 
 
 		 707 aa  618  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.34 
 
 		 631 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.05 
 
 		 710 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.25 
 
 		 625 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.86 
 
 		 633 aa  611  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.43 
 
 		 603 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2090  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.96 
 
 		 621 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.61 
 
 		 739 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.08 
 
 		 647 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.83 
 
 		 605 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.16 
 
 		 618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.69 
 
 		 622 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.18 
 
 		 621 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.05 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.56 
 
 		 748 aa  569  1e-161  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.05 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.84 
 
 		 600 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.89 
 
 		 603 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.08 
 
 		 601 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.93 
 
 		 599 aa  552  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.24 
 
 		 714 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.14 
 
 		 620 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.87 
 
 		 611 aa  541  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.51 
 
 		 599 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.61 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.67 
 
 		 608 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>