More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0081 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0081  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  661    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  39.06 
 
 
319 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0183  hypothetical protein  30.19 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5795  hypothetical protein  30.43 
 
 
331 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0293168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  30.07 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1072  hypothetical protein  29.47 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0296212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  32.69 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  33.92 
 
 
330 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4279  hypothetical protein  33.68 
 
 
339 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5204  hypothetical protein  32.67 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1953  hypothetical protein  31.85 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  28.57 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  29.75 
 
 
322 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1436  hypothetical protein  30.79 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779932  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1404  hypothetical protein  29.25 
 
 
328 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  32.29 
 
 
326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5610  hypothetical protein  31.8 
 
 
333 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2348  hypothetical protein  31.32 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2002  hypothetical protein  27.63 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  32.34 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0114  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  30.13 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0097  hypothetical protein  33.33 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1047  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0384871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2157  hypothetical protein  26.54 
 
 
319 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  30.6 
 
 
345 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  31.48 
 
 
339 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.14 
 
 
333 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4263  hypothetical protein  30.07 
 
 
324 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.41 
 
 
351 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  31.92 
 
 
333 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  30.51 
 
 
333 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  29.72 
 
 
323 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  31.92 
 
 
339 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  28.05 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  32.41 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3813  extra-cytoplasmic solute receptor  28.93 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3411  hypothetical protein  31.96 
 
 
330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  29.97 
 
 
326 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  28.22 
 
 
350 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  31.42 
 
 
327 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  31.42 
 
 
325 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  31.32 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  32.88 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.54 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  30.12 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3496  hypothetical protein  29.01 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.192421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  29.2 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  31.53 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  29.96 
 
 
318 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  30.6 
 
 
338 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1077  hypothetical protein  25.53 
 
 
317 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.055057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  31.39 
 
 
349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  25.33 
 
 
327 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  31.01 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1801  hypothetical protein  27.84 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000114766 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  29.39 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  32.13 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.21 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5116  hypothetical protein  29.59 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.855195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0210  hypothetical protein  29.47 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3092  hypothetical protein  25.78 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.23333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  29.93 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  29.51 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  31.32 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4804  hypothetical protein  29.5 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.589881  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  29.14 
 
 
330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  29.39 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  31.6 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  31.41 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  29.7 
 
 
332 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  26.79 
 
 
318 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  30.93 
 
 
356 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  27.4 
 
 
328 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  29.01 
 
 
329 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  31.72 
 
 
338 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  30.37 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  30.28 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0061  hypothetical protein  29.45 
 
 
333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  31.8 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  32.29 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  29.28 
 
 
314 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  31.36 
 
 
328 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  29.55 
 
 
326 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  29.59 
 
 
329 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0720  hypothetical protein  28.62 
 
 
377 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  27.05 
 
 
328 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  28.29 
 
 
364 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  32.08 
 
 
335 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2041  hypothetical protein  30.65 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  31.23 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  29.64 
 
 
322 aa  112  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  31.75 
 
 
339 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  30.8 
 
 
333 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  30.63 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1189  hypothetical protein  30.38 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>