More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0080 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
266 aa  540  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  62.41 
 
 
266 aa  341  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  62.74 
 
 
268 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  63.12 
 
 
267 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  60.15 
 
 
262 aa  318  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.65 
 
 
266 aa  316  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  57.58 
 
 
266 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  59.39 
 
 
262 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  56.81 
 
 
261 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.89 
 
 
266 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  56.39 
 
 
265 aa  294  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
265 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  54.72 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  56.39 
 
 
264 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.25 
 
 
267 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
287 aa  262  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.2 
 
 
287 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
272 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  51.34 
 
 
278 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
260 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
260 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.06 
 
 
267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
260 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  49.81 
 
 
260 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  47.92 
 
 
266 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  47.29 
 
 
269 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.87 
 
 
273 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.82 
 
 
268 aa  237  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.03 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
261 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
261 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  49.21 
 
 
261 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
264 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.48 
 
 
257 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4708  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  46 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.740902  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.8 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
268 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
264 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
265 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
262 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
273 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
260 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
259 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.19 
 
 
273 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.68 
 
 
271 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  35.5 
 
 
259 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.83 
 
 
260 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.01 
 
 
269 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
264 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
264 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2280  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
260 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.72 
 
 
263 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  35.58 
 
 
279 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
271 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  40.75 
 
 
257 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2697  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.88 
 
 
261 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000960685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.06 
 
 
267 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
273 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  34.94 
 
 
261 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.95 
 
 
258 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
266 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
263 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
263 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1007  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 
268 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0394132  normal  0.416102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
280 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.08 
 
 
264 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
265 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.11 
 
 
268 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 
264 aa  152  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  35.16 
 
 
264 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  35.69 
 
 
261 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  36.25 
 
 
259 aa  152  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  35.29 
 
 
260 aa  151  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.22 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.15 
 
 
280 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.78 
 
 
263 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.5 
 
 
257 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.08 
 
 
258 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.26 
 
 
264 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
270 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.26 
 
 
262 aa  150  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  36.54 
 
 
257 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.92 
 
 
267 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3787  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
259 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.010448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>