258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0070 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  73.17 
 
 
638 aa  935    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  60.25 
 
 
647 aa  775    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  77.13 
 
 
634 aa  979    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  58.04 
 
 
658 aa  754    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  70.91 
 
 
632 aa  944    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  76.8 
 
 
643 aa  959    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  57.57 
 
 
642 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  100 
 
 
635 aa  1293    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  52.07 
 
 
732 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  50.56 
 
 
732 aa  675    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  51.53 
 
 
726 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  58.43 
 
 
658 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 
738 aa  674    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  57.57 
 
 
644 aa  748    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  53.24 
 
 
737 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  57.57 
 
 
646 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  86.93 
 
 
636 aa  1112    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  99.52 
 
 
707 aa  1281    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0533  radical SAM domain protein  75.44 
 
 
138 aa  184  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
590 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  29.61 
 
 
715 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  33.2 
 
 
705 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 
500 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 
716 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 
525 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
429 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  27.18 
 
 
502 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
531 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 
503 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
565 aa  90.5  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  25.6 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
487 aa  82  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  25.67 
 
 
488 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.86 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  26.65 
 
 
486 aa  74.7  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.06 
 
 
567 aa  73.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 
488 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.48 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.92 
 
 
547 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  22.85 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  22.85 
 
 
494 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
521 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.62 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0968  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 
630 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 
723 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.55 
 
 
546 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.56 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.28 
 
 
546 aa  70.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 
461 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
634 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.38 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.28 
 
 
546 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  24.01 
 
 
548 aa  68.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2379  Radical SAM domain protein  21.14 
 
 
623 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  22.05 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
1250 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.57 
 
 
565 aa  67.4  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25 
 
 
535 aa  67  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  29.59 
 
 
613 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.77 
 
 
567 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 
473 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
583 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  24.23 
 
 
675 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.3 
 
 
558 aa  64.7  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2407  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
471 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 
426 aa  64.3  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.84 
 
 
580 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 
525 aa  64.3  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
424 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  24.32 
 
 
864 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
576 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 
470 aa  63.5  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
576 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 
518 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.53 
 
 
681 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.15 
 
 
520 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 
426 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
469 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.53 
 
 
548 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.03 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 
502 aa  61.6  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
458 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1125  Fe-S oxidoreductase  21.65 
 
 
555 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
520 aa  61.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 
520 aa  61.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
471 aa  60.5  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  22.51 
 
 
459 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 
488 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 
424 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  22.76 
 
 
633 aa  60.1  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 
528 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>