More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0055 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  808    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  80.99 
 
 		 420 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  76.56 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  67.07 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  72.24 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  70.77 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  64.48 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 440 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  47.36 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  46.57 
 
 		 411 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  34.46 
 
 		 407 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  34.09 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.39 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0751  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 398 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1587  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1340  major facilitator superfamily multidrug (fosmidomycin) efflux transporter  26.76 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  26.35 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 402 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  28.62 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1472  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  29.79 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  24.25 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  26.6 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4063  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  25.35 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  25.35 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  24.56 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  25 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  23.7 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>