12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0053 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0053  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.498454  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4988  hypothetical protein  60 
 
 
207 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3581  hypothetical protein  54.71 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23858  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4803  hypothetical protein  56.19 
 
 
207 aa  211  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100222  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5049  hypothetical protein  59.57 
 
 
209 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.256189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5404  hypothetical protein  58.12 
 
 
237 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4705  hypothetical protein  57.59 
 
 
243 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3658  hypothetical protein  57.59 
 
 
243 aa  204  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0370725  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3863  hypothetical protein  57.98 
 
 
234 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3563  hypothetical protein  57.45 
 
 
231 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134432  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0855  hypothetical protein  54.97 
 
 
237 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2450  hypothetical protein  53.4 
 
 
193 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>