More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0044 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0044  NADPH-dependent FMN reductase  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0025  NADPH-dependent FMN reductase  99.48 
 
 
194 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1062  NADPH-dependent FMN reductase  72.77 
 
 
201 aa  280  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0050  NADPH-dependent FMN reductase  76.19 
 
 
193 aa  276  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0072  NADPH-dependent FMN reductase  66.84 
 
 
192 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.966553  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0045  NADPH-dependent FMN reductase  68.42 
 
 
195 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0652  NADPH-dependent FMN reductase  40.84 
 
 
195 aa  141  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2576  NADPH-dependent FMN reductase  42.44 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.410047  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02783  redicted flavoprotein  40.41 
 
 
188 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0543  hypothetical protein  45.66 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0508  hypothetical protein  44.91 
 
 
192 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.191573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2887  NADPH-dependent FMN reductase  41.97 
 
 
190 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.534509  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5127  NADPH-dependent FMN reductase  38.22 
 
 
230 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0200  NADPH-dependent FMN reductase  37.7 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0787  NADPH-dependent FMN reductase  35.83 
 
 
192 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0682  NADPH-dependent FMN reductase  38.46 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0332  NADPH-dependent FMN reductase  38.38 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1666  NADPH-dependent FMN reductase  38.04 
 
 
216 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.210753  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0339  NADPH-dependent FMN reductase  36.76 
 
 
193 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0468991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0432  NADPH-dependent FMN reductase  37.84 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2081  NADPH-dependent FMN reductase  38.57 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.161709  normal  0.505082 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
187 aa  94.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  36.7 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0388  NADPH-dependent FMN reductase  37.3 
 
 
193 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  38.6 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0194  putative NADPH-dependent FMN reductase  33.86 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787949  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  38.6 
 
 
185 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  37.64 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  34.97 
 
 
180 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  34.59 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  40 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  34.64 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  36.99 
 
 
220 aa  85.1  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  36.22 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  37.24 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3409  NADPH-dependent FMN reductase  34.78 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3463  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654683  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  36.81 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2360  hypothetical protein  35.33 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4467  hypothetical protein  34.95 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.5 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1278  NADPH-dependent FMN reductase  35.75 
 
 
187 aa  82  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4138  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4071  NADPH-dependent FMN reductase  32.42 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  34.55 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  36.9 
 
 
185 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1182  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3710  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1209  NADPH-dependent FMN reductase  29.65 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  34.69 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2506  hypothetical protein  35.77 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  38.24 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  32.94 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  35.52 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3996  NADPH-dependent FMN reductase  32.93 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.938741  hitchhiker  0.00000030757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  35.52 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  33.33 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  35.52 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  31.69 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  35.52 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  35.52 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13071  hypothetical protein  41.67 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.230913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  32.79 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  34.12 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3798  NADPH-dependent FMN reductase  36.96 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000652253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3708  FMN reductase, NADPH-dependent  34.12 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  31.63 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  38.13 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  37.59 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  31.52 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2443  NADPH-dependent FMN reductase  27.55 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000556188  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  33.91 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  34.81 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2933  NADPH-dependent FMN reductase  31.21 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.89226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>