205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0036 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0036  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
65 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.749635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0018  heavy metal transport/detoxification protein  98.46 
 
 
65 aa  131  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  80 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  65.62 
 
 
64 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 
65 aa  77.4  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  53.97 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  54.1 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  51.72 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  54.39 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  52.54 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  48.48 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  48.48 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1570  hypothetical protein  52.63 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4576  heavy metal transport/detoxification protein  56.9 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.016584  normal  0.0171789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3525  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9865  hypothetical protein  40.32 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2225  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
66 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.708694  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3894  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
73 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2465  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.677036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  47.46 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1779  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616941  decreased coverage  0.00478886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1951  transglutaminase-like  38.33 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.441972  normal  0.32765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4089  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.787932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  50.91 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
65 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5025  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.727014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.91 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  40 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1641  chaperonin  44.83 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0737624 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3536  hypothetical protein  36.21 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1787  hypothetical protein  38.33 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.523797  normal  0.0975189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  41.27 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  34.85 
 
 
67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  43.55 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  41.54 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1134  Heavy metal transport/detoxification protein  34.43 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  41.27 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1772  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.350999  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  40.62 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  38.81 
 
 
68 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  37.88 
 
 
67 aa  47  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  37.88 
 
 
67 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7878  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
69 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  39.68 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  38.46 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
726 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  37.7 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  38.1 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0942  heavy metal-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3497  heavy metal transport/detoxification protein  43.1 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2309  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369838  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  37.7 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0936  heavy metal-binding domain-containing protein  37.93 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4064  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  41.94 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3788  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.055506  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.92 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0408  hypothetical protein  37.93 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000230942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0389  hypothetical protein  37.93 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0449  hypothetical protein  37.93 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68228e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.51 
 
 
732 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.51 
 
 
732 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  34.92 
 
 
732 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.51 
 
 
732 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>