More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0035 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
167 aa  338  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  97.01 
 
 
167 aa  324  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  82.17 
 
 
144 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  85.16 
 
 
134 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  71.65 
 
 
134 aa  193  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0023  MerR family transcriptional regulator  69.77 
 
 
239 aa  190  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  70.31 
 
 
138 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  65.38 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
159 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3534  MerR family transcriptional regulator  65.32 
 
 
143 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0358234  normal  0.617564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  59.2 
 
 
133 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  58.7 
 
 
147 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  59.26 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  58.65 
 
 
154 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.68 
 
 
154 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  56.82 
 
 
159 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.68 
 
 
154 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.68 
 
 
154 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.68 
 
 
154 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  59.68 
 
 
154 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  57.94 
 
 
159 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  57.6 
 
 
132 aa  157  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  57.48 
 
 
137 aa  157  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
149 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  57.14 
 
 
154 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  54.68 
 
 
147 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  59.38 
 
 
149 aa  157  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
171 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
136 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  60.63 
 
 
152 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  55.47 
 
 
133 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 
136 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 
136 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  55.2 
 
 
149 aa  154  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  58.87 
 
 
128 aa  154  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3242  transcriptional regulator, MerR family  58.59 
 
 
132 aa  154  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  58.4 
 
 
149 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
134 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
149 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  56.69 
 
 
139 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  56 
 
 
147 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  53.91 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  59.2 
 
 
132 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  55.91 
 
 
132 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  53.6 
 
 
149 aa  151  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  54.84 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  56.45 
 
 
143 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 
155 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 
152 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  55.65 
 
 
149 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  52.76 
 
 
132 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  52.45 
 
 
159 aa  147  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  53.54 
 
 
129 aa  146  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2318  MerR family transcriptional regulator  54.62 
 
 
143 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  55.12 
 
 
141 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  54.55 
 
 
144 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 
142 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  51.56 
 
 
138 aa  144  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  56 
 
 
134 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  56 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  51.18 
 
 
137 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  56 
 
 
134 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 
142 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50.79 
 
 
132 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  48.85 
 
 
136 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  55.2 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  54.33 
 
 
142 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  50.74 
 
 
137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
137 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  52 
 
 
131 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  54.4 
 
 
134 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
142 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
134 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
157 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1130  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
140 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1387  transcriptional regulator, MerR family  52.8 
 
 
140 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124433  hitchhiker  0.00107932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1805  transcriptional regulator, MerR family  53.6 
 
 
142 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.665763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.21 
 
 
135 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  52.27 
 
 
139 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
134 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  46.92 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
134 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0089  MerR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
137 aa  134  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  46.92 
 
 
129 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  52 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
130 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2999  transcriptional regulator, MerR family  51.18 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  47.2 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  47.24 
 
 
132 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3690  regulatory protein, MerR  46.27 
 
 
143 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
136 aa  120  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 
128 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  38.58 
 
 
126 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
166 aa  104  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
129 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>