More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0027 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 450 aa  893    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  79.71 
 
 		 447 aa  668    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2923  sodium:dicarboxylate symporter  82.13 
 
 		 442 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  99.78 
 
 		 450 aa  892    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02396  C4-dicarboxylate transporter DctA  77.83 
 
 		 434 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91259  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  70.72 
 
 		 444 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0294  C4-dicarboxylate transporter DctA  73.26 
 
 		 449 aa  618  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0264  C4-dicarboxylate transporter DctA  73.15 
 
 		 449 aa  616  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.608146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.86 
 
 		 444 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  72.01 
 
 		 443 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  72.33 
 
 		 455 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  69 
 
 		 454 aa  597  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  70.14 
 
 		 447 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  67.88 
 
 		 446 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  69.11 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  70.91 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  70.02 
 
 		 425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  68.69 
 
 		 449 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  69.6 
 
 		 447 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  68.47 
 
 		 447 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  69.42 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  67.76 
 
 		 448 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  66.13 
 
 		 446 aa  548  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0183  sodium:dicarboxylate symporter  65.58 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0228  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.53 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  58.62 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2259  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.21 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2873  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.21 
 
 		 430 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2884  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.97 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0997591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2790  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.92 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6215  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.44 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2928  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.92 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0430  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.68 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  58.14 
 
 		 460 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.64 
 
 		 450 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0277  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.71 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.61 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0399  C4-dicarboxylate transporter DctA  62.05 
 
 		 444 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.37 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  58.72 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.53 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0640  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.96 
 
 		 444 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0476  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.87 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.43 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.93 
 
 		 442 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0456  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.87 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  57.66 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.38 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3228  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.63 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.85 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4744  sodium:dicarboxylate symporter  58.02 
 
 		 453 aa  501  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.42 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2815  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.63 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.85 
 
 		 440 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  57.66 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.66 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0204  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.63 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  58.49 
 
 		 439 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1389  C4-dicarboxylate transporter DctA  61.63 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.61 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.53 
 
 		 448 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.51 
 
 		 428 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  58.96 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.81 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.23 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.65 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.81 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.81 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.65 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.89 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.17 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  57.97 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.65 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.03 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  54.93 
 
 		 451 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.85 
 
 		 428 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.06 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.35 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0518  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.38 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51947  normal  0.633866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1364  sodium:dicarboxylate symporter  54.35 
 
 		 438 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.150129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1856  sodium:dicarboxylate symporter  55.42 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1777  sodium:dicarboxylate symporter  55.42 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  56.98 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2100  Sodium/dicarboxylate symporter  55.14 
 
 		 440 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4108  sodium:dicarboxylate symporter  60.15 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.311636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0225  C4-dicarboxylate transporter DctA  59.06 
 
 		 426 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4340  C4-dicarboxylate transporter DctA  58.06 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4197  C4-dicarboxylate transporter DctA  60.38 
 
 		 426 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2601  sodium:dicarboxylate symporter  53.13 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0835858  normal  0.133431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  55.07 
 
 		 442 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2279  sodium:dicarboxylate symporter  55.27 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316015  normal  0.71556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>