247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0098 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0098  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0010  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.410032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0018  tRNA-Arg  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000291564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0005  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000297571  hitchhiker  0.000000952712 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0013  tRNA-Arg  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0697011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0017  tRNA-Arg  91.04 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0011  tRNA-Arg  90.77 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486376  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0011  tRNA-Arg  90.77 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0048  tRNA-Arg  95.45 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000000768741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0033  tRNA-Arg  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0033  tRNA-Arg  90 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0046  tRNA-Arg  89.55 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.979271  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0015  tRNA-Arg  89.55 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0018  tRNA-Arg  89.23 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0048  tRNA-Arg  95.12 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.427603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  88.33 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0010  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0094  tRNA-Arg  88.06 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0024  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.826949  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0003  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.611935  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0004  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0042  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0016  tRNA-Arg  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000000601684  hitchhiker  0.000695383 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAArgVIMSS1309364  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAArgVIMSS1309121  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAArgVIMSS1309188  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.451708  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAArgVIMSS1309146  tRNA-Arg  94.74 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.465362  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0022  tRNA-Arg  91.3 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0015  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000253898  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0053  tRNA-Arg  89.47 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.30391  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0009  tRNA-Arg  87.69 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000808777  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA31  tRNA-Arg  92.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216391  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0002  tRNA-Arg  86.57 
 
 
79 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000443996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0047  tRNA-Arg  95 
 
 
76 bp  56  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070675  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0030  tRNA-Arg  95 
 
 
76 bp  56  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0085  tRNA-Arg  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000064682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0008  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0047  tRNA-Arg  96.77 
 
 
77 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151392  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  85.07 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0026  tRNA-Arg  86.44 
 
 
74 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335207  hitchhiker  0.00751265 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  92.31 
 
 
74 bp  54  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  96.77 
 
 
74 bp  54  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0011  tRNA-Arg  96.67 
 
 
73 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.87033e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0001  tRNA-Arg  85.14 
 
 
78 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  92.11 
 
 
74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0045  tRNA-Arg  92.11 
 
 
77 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000165448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0057  tRNA-Arg  84.93 
 
 
73 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194543  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0022  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000177446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0022  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00187223  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0049  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163876  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1462  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00149673  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0022  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000850812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0011  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966891  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0057  tRNA-Arg  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0032  tRNA-Arg  91.67 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.178807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0009    91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.956254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0022  tRNA-Arg  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0027696  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0002  tRNA-Arg  94.44 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0053  tRNA-Arg  87.5 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0008  tRNA-Arg  91.67 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14028  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.989e-27  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0014  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0177881  hitchhiker  0.00685945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0002  tRNA-Arg  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0036  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466026  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0016  tRNA-Arg  89.36 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  93.55 
 
 
80 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0116  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000399679  normal  0.0138295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0116  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000104257  normal  0.0490719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>