299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0088 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.00461e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  98.36 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.50994e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  98.25 
 
 
77 bp  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.00399e-07  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  98.21 
 
 
77 bp  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.71008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0062  tRNA-Arg  96.61 
 
 
77 bp  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0906817  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0051  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  92.21 
 
 
76 bp  97.6  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.38552e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.78277e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  1.87168e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  1.34564e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0116  tRNA-Arg  90.67 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.0989e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  94.92 
 
 
77 bp  93.7  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  6.81563e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.81838e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  3.59807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  94.64 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0055  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300592 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  94.64 
 
 
74 bp  87.7  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  85.7  1e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.49468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  89.33 
 
 
77 bp  85.7  1e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  93.22 
 
 
77 bp  85.7  1e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.33 
 
 
80 bp  85.7  1e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.68657e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  93.1 
 
 
74 bp  83.8  5e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09730  tRNA-Arg  89.86 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  8.19113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0029  tRNA-Arg  91.8 
 
 
77 bp  81.8  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323491  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.38631e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  92.86 
 
 
80 bp  79.8  8e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0004  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  8e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.52331e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0091  tRNA-Arg  88 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.02507e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  88.73 
 
 
77 bp  77.8  3e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  7.05596e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  95.65 
 
 
78 bp  75.8  1e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  92.59 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  92.59 
 
 
77 bp  75.8  1e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0071  tRNA-Arg  92.98 
 
 
76 bp  73.8  5e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0216295  normal  0.909849 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0024  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  92.45 
 
 
77 bp  73.8  5e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.91538e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.75321e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  91.07 
 
 
77 bp  71.9  2e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  89.83 
 
 
79 bp  69.9  8e-11  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.465736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0028  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.402062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0027  tRNA-Arg  89.83 
 
 
74 bp  69.9  8e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  89.83 
 
 
77 bp  69.9  8e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  90.57 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  6.20516e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0023  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0598975  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0019  tRNA-Arg  97.3 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0109  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tArg02  tRNA-Arg  88.52 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0040  tRNA-Arg  87.69 
 
 
74 bp  65.9  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.22727e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 
77 bp  65.9  1e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  2.47527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0024  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  90.38 
 
 
79 bp  63.9  5e-09  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.13688e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  89.29 
 
 
79 bp  63.9  5e-09  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0718  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.953055  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0041  tRNA-Arg  89.29 
 
 
74 bp  63.9  5e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.707776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  89.29 
 
 
79 bp  63.9  5e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0001  tRNA-Arg  87.5 
 
 
78 bp  63.9  5e-09  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  90.38 
 
 
79 bp  63.9  5e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0059  tRNA-Arg  89.29 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  89.29 
 
 
79 bp  63.9  5e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  90.38 
 
 
77 bp  63.9  5e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  89.83 
 
 
76 bp  61.9  2e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0009  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  1.52408e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0010  tRNA-Arg  88.14 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  93.02 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  93.02 
 
 
77 bp  61.9  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  88.14 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  93.02 
 
 
74 bp  61.9  2e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  4.27256e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  89.66 
 
 
76 bp  60  8e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  8e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  87.93 
 
 
77 bp  60  8e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>