122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0053 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0053  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0223382  normal  0.521756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0026  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2137  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2212  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249062  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0050  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000000388549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0051  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1683  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.792102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0040  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000753452  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0038  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0257046  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0022  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0911  tRNA-Arg  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0732179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0024  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0035  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2650599999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  85.25 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>