269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0046 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0046  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0037  tRNA-Gln  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0028  tRNA-Gln  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0028  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0050  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000077158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0048  tRNA-Gln  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0015  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0106  tRNA-Gln  89.55 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0074  tRNA-Gln  89.55 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0049  tRNA-Gln  89.55 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0074  tRNA-Gln  89.55 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna0  tRNA-Gln  91.38 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0035  tRNA-Gln  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000188395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0068  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.118963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0024  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6019500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  88.31 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0041  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0032  tRNA-Gln  95.12 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00171845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0041  tRNA-Gln  91.23 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.794543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0007  tRNA-Gln  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000424664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0050  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000011016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0035  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00008  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000112561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0687  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000017545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0580  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000400154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0066  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.69731e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0791  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0431042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0686  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000180239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4649  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000820589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0757  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000702107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0758  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000782067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0030  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000433047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5014  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000209766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0079  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0719  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000164709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0080  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4648  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000366514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0078  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.33097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0792  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00549034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0732  tRNA-Gln  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000561331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  88.06 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0042  tRNA-Gln  89.83 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000017431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>