188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4369 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  100 
 
 
109 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  44.95 
 
 
113 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  42.45 
 
 
115 aa  94.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00185e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  45.1 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.05817e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  44.79 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.31452e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  41.67 
 
 
131 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  43.14 
 
 
109 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 
107 aa  81.6  3e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  39.6 
 
 
116 aa  77.4  6e-14  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  41.67 
 
 
115 aa  77  9e-14  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  37.96 
 
 
126 aa  76.3  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.13724e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  5.60819e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  41.67 
 
 
115 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  40 
 
 
115 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  40.62 
 
 
121 aa  75.1  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.02449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  41.67 
 
 
119 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  42.71 
 
 
115 aa  75.1  3e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  40 
 
 
115 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  40.62 
 
 
115 aa  72.8  1e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 
116 aa  72.4  2e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.04064e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  37.74 
 
 
118 aa  72.8  2e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  38.54 
 
 
119 aa  72  3e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  39.09 
 
 
125 aa  71.6  3e-12  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  8.22394e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  39.09 
 
 
125 aa  71.6  3e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  39.81 
 
 
117 aa  70.5  8e-12  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 
119 aa  68.6  3e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.58886e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  35.58 
 
 
117 aa  67.4  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  35.58 
 
 
117 aa  67.4  6e-11  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 
111 aa  67.4  7e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.23477e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  30.28 
 
 
130 aa  65.9  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  34.55 
 
 
115 aa  65.5  2e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  6.762e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  39.56 
 
 
116 aa  65.9  2e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.8083e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  32.38 
 
 
132 aa  65.5  2e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 
114 aa  64.7  4e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  35.24 
 
 
109 aa  64.3  5e-10  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1042  ribonuclease P protein component  37.36 
 
 
120 aa  63.5  9e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00401916  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  40.3 
 
 
110 aa  63.5  1e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  36.11 
 
 
111 aa  63.2  1e-09  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.76815e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  34.31 
 
 
109 aa  63.2  1e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  32.97 
 
 
130 aa  62.8  1e-09  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  39.44 
 
 
117 aa  62  3e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 
117 aa  61.6  3e-09  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.71159e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  40 
 
 
121 aa  61.2  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  42.5 
 
 
129 aa  60.8  7e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  2.99838e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1542  ribonuclease P protein component  33.05 
 
 
162 aa  60.1  9e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.200332  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  36.36 
 
 
110 aa  58.9  2e-08  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  36.71 
 
 
109 aa  59.3  2e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  34.09 
 
 
125 aa  59.3  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  6.17506e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  36.19 
 
 
145 aa  59.3  2e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  30.84 
 
 
130 aa  58.5  3e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  28.97 
 
 
120 aa  58.2  4e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  5.12551e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2513  ribonuclease P  35 
 
 
118 aa  57.8  5e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.77039e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0925  ribonuclease P protein component  35.16 
 
 
126 aa  57.4  6e-08  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  8.41875e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  32.04 
 
 
121 aa  57.4  6e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  36.19 
 
 
145 aa  57.4  7e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5311  ribonuclease P  35.64 
 
 
134 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0346243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0008  ribonuclease P  35.64 
 
 
134 aa  57.4  7e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55186e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5745  ribonuclease P  36.96 
 
 
133 aa  57  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936025  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52470  ribonuclease P  33 
 
 
130 aa  56.2  1e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  38 
 
 
117 aa  56.2  1e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  36.9 
 
 
116 aa  56.6  1e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.75953e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0096  ribonuclease P  43.75 
 
 
133 aa  56.2  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0001  ribonuclease P  35.64 
 
 
134 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0081  ribonuclease P  43.75 
 
 
133 aa  55.8  2e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.284943 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_913  RNase P protein component  36.26 
 
 
126 aa  55.1  3e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  6.01305e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  40 
 
 
132 aa  55.5  3e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0454  ribonuclease P  41.43 
 
 
129 aa  55.1  3e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0715455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5136  ribonuclease P  35.87 
 
 
133 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5614  ribonuclease P protein component  35.87 
 
 
133 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4622  ribonuclease P  35 
 
 
134 aa  55.5  3e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0080  ribonuclease P  43.28 
 
 
132 aa  54.7  4e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 
116 aa  54.3  5e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  32.29 
 
 
116 aa  54.3  5e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73420  ribonuclease P  34.44 
 
 
135 aa  53.9  7e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0472215  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  37.11 
 
 
119 aa  53.5  9e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4259  ribonuclease P  32 
 
 
120 aa  53.5  1e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.42435e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0766  ribonuclease P protein component  27.36 
 
 
123 aa  52.8  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  9.48284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  34 
 
 
117 aa  53.1  1e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6370  ribonuclease P  34.44 
 
 
135 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3327  ribonuclease P protein component  39.24 
 
 
227 aa  53.5  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.542591  normal  0.0367737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00437  ribonuclease P  34 
 
 
118 aa  52.4  2e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0890  ribonuclease P protein component  31.33 
 
 
180 aa  52.4  2e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0029715 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  35.29 
 
 
135 aa  52.8  2e-06  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3897  ribonuclease P protein component  36.79 
 
 
132 aa  52  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2523  ribonuclease P protein component  39.19 
 
 
93 aa  52  3e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0265349  hitchhiker  6.5266e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  28.16 
 
 
113 aa  51.6  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  30.34 
 
 
116 aa  52  3e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  34.65 
 
 
122 aa  51.6  3e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002014  ribonuclease P protein component  34 
 
 
107 aa  52  3e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.92203e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  30.68 
 
 
116 aa  51.6  4e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 
115 aa  51.2  5e-06  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  2.86956e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  30.63 
 
 
116 aa  51.2  5e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  40.28 
 
 
116 aa  51.2  5e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1200  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 
150 aa  50.8  6e-06  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00390619 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  34.94 
 
 
122 aa  50.4  8e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  29 
 
 
119 aa  50.4  9e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  29.55 
 
 
116 aa  50.1  9e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>