More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4355 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 95 aa  193  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  61.05 
 
 		 95 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  54.74 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  58.51 
 
 		 94 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  53.68 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  51.58 
 
 		 95 aa  110  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  50 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  44.21 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  49.45 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  48.91 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  43.16 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  43.75 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  44.57 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 98 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  47.25 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  47.92 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0582  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.147466  hitchhiker  0.0000000000000103542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  38.95 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0420  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000077892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0428  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.531029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  40 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  40 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1364  ribosomal protein S6  40 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 95 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  38.46 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 97 aa  84.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0888  SSU ribosomal protein S6P  35.87 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  41.3 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07640  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0515  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.38245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>