More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4354 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  100 
 
 
148 aa  298  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  60.14 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  59.33 
 
 
140 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  52.9 
 
 
154 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  54.73 
 
 
139 aa  155  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  52.7 
 
 
142 aa  152  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  50.68 
 
 
137 aa  147  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  51.7 
 
 
156 aa  144  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  49.32 
 
 
140 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.99 
 
 
148 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  47.44 
 
 
156 aa  140  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  45.12 
 
 
164 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 
173 aa  134  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 
173 aa  134  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 
173 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  43.93 
 
 
173 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
170 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.73 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  43.35 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  43.6 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  43.6 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  43.79 
 
 
169 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  45.12 
 
 
164 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  43.02 
 
 
172 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  46.26 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  57.66 
 
 
133 aa  128  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  59.09 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  42.68 
 
 
150 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  45.77 
 
 
188 aa  121  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.31 
 
 
156 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.31 
 
 
156 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.31 
 
 
156 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.31 
 
 
156 aa  120  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  40.72 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  39.86 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  40.72 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  40.49 
 
 
163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.95 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.95 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  37.79 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  52.88 
 
 
169 aa  117  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  39.76 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  41.33 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  35.83 
 
 
187 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.95 
 
 
172 aa  114  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  42.86 
 
 
134 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  40.27 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  42.22 
 
 
185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  37.8 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  51.4 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  45.31 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  39.39 
 
 
166 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  45.08 
 
 
174 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  41.54 
 
 
142 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  41.72 
 
 
141 aa  104  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.49 
 
 
157 aa  104  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  50.93 
 
 
141 aa  103  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.36 
 
 
160 aa  103  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  46.28 
 
 
138 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  35.76 
 
 
151 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  44.09 
 
 
180 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.83 
 
 
156 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  37.91 
 
 
152 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  38.26 
 
 
135 aa  101  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  38.26 
 
 
135 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.97 
 
 
157 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  46.73 
 
 
119 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  37.58 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  50.48 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.04 
 
 
166 aa  97.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  37.5 
 
 
171 aa  97.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  38.56 
 
 
152 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  48.15 
 
 
161 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  44.92 
 
 
171 aa  97.1  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  44.23 
 
 
186 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  47.17 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  40.13 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  42.2 
 
 
166 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 
111 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  40.74 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  39.61 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  43.69 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  37.21 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 
111 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.5 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  44.44 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  44.44 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  46.3 
 
 
224 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  37.5 
 
 
157 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  39.1 
 
 
158 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  37.69 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  34.86 
 
 
173 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  42.31 
 
 
167 aa  92  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>