More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4351 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  291  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  52.41 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  45.27 
 
 
150 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  47.59 
 
 
147 aa  135  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  44.85 
 
 
150 aa  130  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
148 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  37.16 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  47.55 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.76 
 
 
146 aa  122  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
160 aa  122  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 
151 aa  122  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  45.45 
 
 
148 aa  121  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
151 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  39.46 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1422  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0660955  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  44.14 
 
 
148 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.45 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
147 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
149 aa  117  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  34.93 
 
 
151 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  42.07 
 
 
149 aa  116  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  115  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2972  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
148 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2650  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
148 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.502254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  37.67 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.67 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  38.1 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
152 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  35.86 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 
199 aa  109  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11530  ribosomal protein L9  39.01 
 
 
191 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0446546  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.52 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0894  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000571684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
167 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.48 
 
 
157 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
149 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
148 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
151 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.15 
 
 
146 aa  106  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2135  ribosomal protein L9  41.35 
 
 
148 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
150 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  41.38 
 
 
149 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  41.1 
 
 
151 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  39.19 
 
 
149 aa  104  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  35.57 
 
 
149 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  33.79 
 
 
148 aa  103  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
152 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.86 
 
 
149 aa  103  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
151 aa  103  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
151 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 
148 aa  102  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
147 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
167 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
168 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
152 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  37.84 
 
 
149 aa  101  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  39.31 
 
 
148 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
152 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
204 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
152 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  39.04 
 
 
147 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
168 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  36.24 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
193 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  37.24 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  38.93 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  42.95 
 
 
152 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  37.93 
 
 
201 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  38 
 
 
152 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  36.3 
 
 
148 aa  99  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>