More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4346 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 384 aa  786    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 228 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 225 aa  209  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 224 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 224 aa  203  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 228 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 224 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 227 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 228 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.28 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 226 aa  192  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.44 
 
 		 230 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 246 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 273 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 226 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  43.75 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 234 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 229 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  42.22 
 
 		 257 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.66 
 
 		 229 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  42.86 
 
 		 236 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 225 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.24 
 
 		 231 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 229 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 245 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  42.67 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 223 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 224 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 225 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 225 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 228 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 227 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 235 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 223 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.97 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 227 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 237 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 242 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 234 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 		 237 aa  173  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 230 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 244 aa  172  9e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 223 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 235 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 233 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 242 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1397  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 219 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.0186572 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 240 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  43.58 
 
 		 225 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 242 aa  170  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 228 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.69 
 
 		 233 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 228 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 255 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 254 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0313  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 216 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  40.18 
 
 		 229 aa  169  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 270 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 224 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 223 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 232 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 239 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 226 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 232 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2714  putative two-component response regulator  44.34 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  44.81 
 
 		 250 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 233 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 225 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31960  putative two-component response regulator  44.34 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.029957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.51 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 231 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 233 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.35 
 
 		 233 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 233 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  46.19 
 
 		 228 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>