More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4341 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  100 
 
 
382 aa  783    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  61.58 
 
 
385 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  55 
 
 
384 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  52.38 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  50.13 
 
 
381 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  47.47 
 
 
384 aa  362  8e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  47.2 
 
 
384 aa  358  8e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  46.05 
 
 
400 aa  355  8.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  48.43 
 
 
382 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  48.43 
 
 
382 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  47.48 
 
 
385 aa  349  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  47.54 
 
 
385 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  45.67 
 
 
386 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  48.22 
 
 
382 aa  340  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  44.97 
 
 
383 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.68 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  44.41 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  46.6 
 
 
384 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  45.65 
 
 
382 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  45.12 
 
 
382 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.12 
 
 
382 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  46.45 
 
 
386 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  44.44 
 
 
379 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  45.09 
 
 
384 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  42.74 
 
 
380 aa  329  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  44.36 
 
 
380 aa  329  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  45.09 
 
 
384 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  43.77 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.16 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  44.47 
 
 
382 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  44.57 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  44.57 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  43.73 
 
 
362 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  43.54 
 
 
379 aa  325  9e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  42.71 
 
 
385 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  43.01 
 
 
379 aa  322  8e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  44.41 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  42.9 
 
 
384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  44.81 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  44.76 
 
 
387 aa  319  5e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  43.32 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  45.09 
 
 
397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  42.22 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  42.22 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  44.56 
 
 
382 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  45.48 
 
 
382 aa  311  9e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  42.67 
 
 
382 aa  311  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  43.39 
 
 
387 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  42.54 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.3 
 
 
383 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  42.18 
 
 
401 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  42.45 
 
 
396 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  42.18 
 
 
421 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  41.67 
 
 
396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  41.15 
 
 
399 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  41.47 
 
 
417 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  41.81 
 
 
360 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  42.93 
 
 
380 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  41.53 
 
 
398 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  40.94 
 
 
417 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  37.33 
 
 
395 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  40.1 
 
 
391 aa  281  9e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  42.25 
 
 
400 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  41.04 
 
 
415 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  39.69 
 
 
415 aa  280  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  40.66 
 
 
395 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  40.63 
 
 
398 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  38.6 
 
 
406 aa  276  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  40.9 
 
 
402 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  39.32 
 
 
391 aa  276  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  38.22 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  37.9 
 
 
406 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  38.81 
 
 
406 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  39.06 
 
 
396 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  37.56 
 
 
394 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  39.38 
 
 
391 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.84 
 
 
391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  38.83 
 
 
406 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 
396 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  40.06 
 
 
389 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  45.16 
 
 
381 aa  270  5e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  41.51 
 
 
375 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  36.57 
 
 
413 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  38.73 
 
 
385 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  38.73 
 
 
385 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  38.92 
 
 
396 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  41.21 
 
 
402 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.06 
 
 
391 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  37.05 
 
 
414 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  41.21 
 
 
402 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  39.05 
 
 
401 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  40.69 
 
 
422 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  40.94 
 
 
402 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  40.62 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  41.41 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  38.32 
 
 
401 aa  262  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  42.04 
 
 
376 aa  261  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  37.63 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  39.05 
 
 
395 aa  259  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  37.3 
 
 
403 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>