More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4284 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
104 aa  216  7e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  74.76 
 
 
120 aa  165  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  72.12 
 
 
106 aa  160  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1065  transcriptional regulator, ArsR family  58.76 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  57.58 
 
 
110 aa  121  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1091  arsenical resistance operon repressor  49.04 
 
 
104 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000544872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  48.96 
 
 
107 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  49.33 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  41.76 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  39.39 
 
 
113 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  42.05 
 
 
109 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  49.3 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  49.3 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  47.89 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  47.89 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  43.59 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  43.84 
 
 
95 aa  72  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.18 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  41.56 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  43.04 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0352  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  34.31 
 
 
107 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  41.56 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
107 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1860  regulatory protein ArsR  37.78 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1825  regulatory protein, ArsR  37.78 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  33.98 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  38.96 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  37.04 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  38.24 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0576  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00300248  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 
309 aa  64.3  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  38.03 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2429  arsenical resistance operon repressor  39.44 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 
307 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 
117 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3281  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.25 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2792  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0944  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  36.25 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0793455  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0567  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.702064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  41.1 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  40.91 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.5 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  40.28 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  37.5 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0863  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
307 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  36 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 
108 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.78 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>