177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4195 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4195  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  66.22 
 
 
158 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0733  superoxide dismutase copper/zinc binding  53.64 
 
 
175 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000189816  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  37.76 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  40.41 
 
 
172 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  38.36 
 
 
171 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.84 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  38.04 
 
 
175 aa  88.6  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.14 
 
 
169 aa  88.2  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  33.78 
 
 
169 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.16 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  38.78 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  43.93 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.76 
 
 
175 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.76 
 
 
175 aa  86.3  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.57 
 
 
172 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  38.46 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  36.73 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.97 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.99 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.39 
 
 
183 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.23 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.84 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.49 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.48 
 
 
180 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.39 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  36.36 
 
 
226 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  40.54 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  42.61 
 
 
178 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.9 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.58 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.58 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.01 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.11 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  34.69 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.17 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2380  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.19 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.76 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  31.47 
 
 
510 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  38.94 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  34.01 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  39.29 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.82 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.26 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  29.82 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.96 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.89 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.71 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.41 
 
 
190 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.2 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  38.39 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.26 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.71 
 
 
179 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  31.1 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.82 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.1 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  27.84 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.71 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  37.5 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  30.89 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.75 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  32.21 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.67 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  32.43 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.11 
 
 
172 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  30.87 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.98 
 
 
171 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 
173 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2297  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.5 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2270  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.5 
 
 
162 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  30.87 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0397  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.58 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01606  hypothetical protein  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00112048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2358  superoxide dismutase  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000359959  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1723  superoxide dismutase  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.335611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1857  superoxide dismutase  30.2 
 
 
173 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  30.2 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1419  copper/zinc superoxide dismutase  34.4 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0294455 
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  28.31 
 
 
154 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1082  copper/zinc superoxide dismutase  34.4 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.302029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2767  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  30.32 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1154  copper/zinc superoxide dismutase  34.4 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2210  superoxide dismutase  30.7 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109092  hitchhiker  0.000454174 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  30.12 
 
 
154 aa  59.3  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 
156 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  31.71 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.4 
 
 
170 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.56 
 
 
172 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  27.52 
 
 
171 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  32.21 
 
 
173 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.4 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>