More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4177 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 413 aa  853    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  69.66 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  71.25 
 
 		 413 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  69.59 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  69.31 
 
 		 413 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  67.23 
 
 		 418 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  67.99 
 
 		 417 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 		 420 aa  578  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  65.7 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 412 aa  567  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 416 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  65.1 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  65.44 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 410 aa  559  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  65.44 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  64.37 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.41 
 
 		 415 aa  547  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 413 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 413 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 		 414 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  65.51 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  65.59 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 429 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 431 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 420 aa  531  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  63.21 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 431 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 431 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 435 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 419 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 424 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 431 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  56.88 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 425 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 431 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>