12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4152 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 
366 aa  742    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0134  hypothetical protein  33.78 
 
 
394 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000263159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2120  outer membrane protein-like protein  36.83 
 
 
374 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000810254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2342  Outer membrane protein-like  35.54 
 
 
333 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0045  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 
370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00077566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3141  hypothetical protein  23.48 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.59 
 
 
441 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 
352 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1939  Outer membrane protein-like protein  22.6 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126672  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.55 
 
 
459 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>