More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4150 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
397 aa  795    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  36.94 
 
 
379 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.97 
 
 
377 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 
376 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  39.18 
 
 
287 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 
432 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  26.99 
 
 
451 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.2 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.7 
 
 
405 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 
364 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  28.02 
 
 
405 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  30.05 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  28.78 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.23 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 
426 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.77 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  29.85 
 
 
423 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.97 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.77 
 
 
432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
424 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
400 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.84 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 
379 aa  126  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 
374 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0880  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.57 
 
 
397 aa  126  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.995952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.46 
 
 
399 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  28.79 
 
 
380 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31870  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  29.76 
 
 
426 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.91 
 
 
427 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 
428 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 
379 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  27.95 
 
 
410 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 
453 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2524  RND family efflux transporter MFP subunit  29.92 
 
 
424 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.283395  normal  0.0763035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.41 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 
509 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.31 
 
 
400 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1161  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.71 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444348  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 
421 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.73 
 
 
421 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2482  secretion protein HlyD  29.07 
 
 
434 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179732  normal  0.227362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2708  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.22 
 
 
426 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0286088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  24.87 
 
 
407 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.74 
 
 
438 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  25.2 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  25.75 
 
 
405 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2753  HlyD family secretion protein  29.18 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  24.72 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
399 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2521  secretion protein HlyD  28.19 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  28.62 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.22 
 
 
349 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  25.5 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5875  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955286  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0257  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0635655  hitchhiker  0.00588714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  25 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.16 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  26.12 
 
 
393 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 
438 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.336679  normal  0.260987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.65 
 
 
414 aa  116  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  26.49 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.16 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  27.98 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  26.09 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.55 
 
 
380 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  26.97 
 
 
364 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  25.55 
 
 
484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 
365 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.4 
 
 
471 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.28 
 
 
353 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  26.3 
 
 
376 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 
479 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.44 
 
 
349 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 
386 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2426  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 
365 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.54628  hitchhiker  0.0000000883837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1955  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2420  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304256  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.12 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  26.87 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1513  secretion protein HlyD  26.15 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 
402 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  25.23 
 
 
484 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 
406 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28820  secretion protein, HlyD family  27.79 
 
 
441 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.3 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.32 
 
 
450 aa  110  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 
354 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 
372 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>