82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4116 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  100 
 
 		 540 aa  1084    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.02 
 
 		 467 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  29.87 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  28.14 
 
 		 436 aa  93.2  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 781 aa  91.3  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  30.27 
 
 		 471 aa  90.9  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  29.41 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.29 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.99 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  31.31 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  24.81 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.68 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  26.48 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  22.13 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  29.05 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.92 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.23 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  34 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  32.5 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  23.46 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  28.74 
 
 		 845 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 389 aa  57  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.13 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  22.86 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  21.32 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.42 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  22.78 
 
 		 480 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  29.89 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 501 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  29.06 
 
 		 454 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  29.65 
 
 		 785 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.45 
 
 		 498 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  21.76 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 535 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  26.33 
 
 		 461 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.23 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  23.21 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 464 aa  50.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  22.18 
 
 		 509 aa  50.4  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  31.58 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  28.95 
 
 		 930 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  23.88 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  21.84 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  33.94 
 
 		 1090 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  22.45 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.51 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 444 aa  47  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2667  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  26.2 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  24.28 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  22.66 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  24.05 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  26.75 
 
 		 396 aa  45.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  30.17 
 
 		 894 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.24 
 
 		 463 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  26.04 
 
 		 457 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 1009 aa  44.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  29.45 
 
 		 404 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  30.49 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  30.49 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  30.49 
 
 		 404 aa  43.9  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  21.4 
 
 		 494 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>