More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4110 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
470 aa  962    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  63.56 
 
 
486 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  55.79 
 
 
467 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  54.8 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  54.14 
 
 
471 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  52.35 
 
 
470 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  49.15 
 
 
475 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  48.28 
 
 
475 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  46.34 
 
 
473 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  44.68 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  45.92 
 
 
472 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.71 
 
 
472 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.4 
 
 
474 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.22 
 
 
472 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.97 
 
 
474 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.95 
 
 
469 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.56 
 
 
472 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  42.31 
 
 
488 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  43.56 
 
 
472 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.12 
 
 
467 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  41.74 
 
 
469 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  41.31 
 
 
478 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  41.58 
 
 
471 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  41.34 
 
 
469 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  41.83 
 
 
468 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  41.61 
 
 
463 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.75 
 
 
469 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.11 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  42.37 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  40.25 
 
 
470 aa  340  5e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  38.17 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  40.04 
 
 
470 aa  335  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  39.65 
 
 
474 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  39.25 
 
 
475 aa  330  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.41 
 
 
470 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  39.74 
 
 
473 aa  326  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  39.62 
 
 
470 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  39.53 
 
 
484 aa  323  4e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  36.62 
 
 
457 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  37.83 
 
 
458 aa  315  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  38.38 
 
 
733 aa  312  6.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  39.17 
 
 
460 aa  310  2e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.13 
 
 
464 aa  305  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  37.76 
 
 
482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.88 
 
 
475 aa  300  5e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  38.38 
 
 
472 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.79 
 
 
463 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  35.31 
 
 
479 aa  293  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  36.13 
 
 
503 aa  293  7e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  35.51 
 
 
460 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  35.9 
 
 
460 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  34.17 
 
 
480 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  34.17 
 
 
480 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  35.28 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  35.95 
 
 
460 aa  282  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  35.08 
 
 
460 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  35.73 
 
 
460 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  35.11 
 
 
490 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.01 
 
 
480 aa  280  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  33.47 
 
 
478 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  36.5 
 
 
468 aa  276  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  35.61 
 
 
501 aa  276  7e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  34.2 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  35.59 
 
 
477 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  35.56 
 
 
467 aa  269  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  33.76 
 
 
484 aa  269  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  33.26 
 
 
486 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  35.27 
 
 
465 aa  259  6e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  33.48 
 
 
486 aa  259  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.71 
 
 
473 aa  259  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.32 
 
 
414 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.91 
 
 
487 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.48 
 
 
487 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  35.09 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  34.05 
 
 
485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  35.71 
 
 
470 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  33.55 
 
 
486 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.74 
 
 
518 aa  237  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  34.05 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  31.56 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  31.84 
 
 
484 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.13 
 
 
484 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.58 
 
 
471 aa  224  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  31.45 
 
 
548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  31.7 
 
 
548 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  31.37 
 
 
545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  31.84 
 
 
548 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  30.64 
 
 
553 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  30.43 
 
 
549 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  30.97 
 
 
545 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  30.63 
 
 
550 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  30.85 
 
 
545 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  30.85 
 
 
545 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  31.19 
 
 
559 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  31.75 
 
 
549 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  30.24 
 
 
545 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  30.14 
 
 
550 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4496  phosphoglucomutase  29.64 
 
 
553 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  30.57 
 
 
547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  30.29 
 
 
545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>