More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3978 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.28235e-09  hitchhiker  2.30998e-07 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  41.33 
 
 
237 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  41.47 
 
 
214 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 
259 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.74 
 
 
243 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 
255 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
229 aa  115  4e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.68 
 
 
253 aa  114  1e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
247 aa  112  4e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.02 
 
 
238 aa  111  1e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.15 
 
 
245 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.43751e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  32.93 
 
 
255 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
223 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  2.98653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.44 
 
 
233 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  1.70778e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.2 
 
 
233 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.36 
 
 
258 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.06 
 
 
233 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.15929e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  32.93 
 
 
249 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  36.9 
 
 
222 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.13263e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.74 
 
 
246 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
220 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.9712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
279 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.54112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.36 
 
 
258 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  34.05 
 
 
244 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.06 
 
 
238 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
239 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.76 
 
 
255 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  31.47 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.53 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.11 
 
 
215 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.69 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.22 
 
 
230 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.39 
 
 
230 aa  95.9  6e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  28.57 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
276 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.45098e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.59 
 
 
270 aa  94  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
264 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.26 
 
 
230 aa  94  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  34.21 
 
 
242 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.33 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  32.43 
 
 
229 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
220 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 
242 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.48 
 
 
245 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
271 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  31.98 
 
 
299 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.15358e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.38 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.85 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.85 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.25 
 
 
246 aa  89  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  34 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.9 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  32 
 
 
241 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  30.29 
 
 
280 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30 
 
 
230 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  26.59 
 
 
262 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.88 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.06 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
217 aa  85.9  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  30.36 
 
 
238 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  38.52 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.44 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  29.91 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.76 
 
 
267 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 
270 aa  84.3  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.93 
 
 
228 aa  84.3  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.15 
 
 
231 aa  85.1  1e-15  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.29 
 
 
227 aa  84  2e-15  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.80305e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  30.42 
 
 
286 aa  84  2e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  31.19 
 
 
234 aa  84  2e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  29.86 
 
 
256 aa  84  2e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.22 
 
 
255 aa  83.6  3e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  33.53 
 
 
261 aa  83.6  3e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  30 
 
 
240 aa  83.2  4e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  26.19 
 
 
262 aa  83.2  4e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  31.55 
 
 
252 aa  82.8  4e-15  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.09 
 
 
243 aa  82.4  7e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.4 
 
 
242 aa  82  7e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
258 aa  82.4  7e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  28.29 
 
 
269 aa  82  7e-15  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
272 aa  82.4  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  31.3 
 
 
266 aa  81.3  1e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
230 aa  81.6  1e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  81.3  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 
271 aa  81.3  1e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
217 aa  81.3  1e-14  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>