More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3952 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
624 aa  1274    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  54.99 
 
 
613 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  55.81 
 
 
614 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  64.03 
 
 
588 aa  806    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  50.87 
 
 
625 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  46.77 
 
 
607 aa  594  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  46.98 
 
 
615 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  48.24 
 
 
641 aa  586  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  47.19 
 
 
620 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  48.95 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  47.03 
 
 
620 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  48.2 
 
 
653 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  48.18 
 
 
685 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  44.89 
 
 
613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  46.96 
 
 
628 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  45.75 
 
 
607 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  45.75 
 
 
607 aa  547  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  45.96 
 
 
613 aa  545  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  45.79 
 
 
607 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  43.16 
 
 
601 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  43.23 
 
 
665 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  43.38 
 
 
669 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  42.2 
 
 
656 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  43.38 
 
 
611 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  44.03 
 
 
666 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  44.17 
 
 
604 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  41.81 
 
 
671 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  44.69 
 
 
609 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  43.22 
 
 
617 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 
619 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  42.88 
 
 
649 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  43.44 
 
 
658 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  44.89 
 
 
615 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  42.76 
 
 
593 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  42.7 
 
 
614 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  41.23 
 
 
677 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  41.25 
 
 
616 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  41.88 
 
 
660 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  41.47 
 
 
638 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  41.55 
 
 
708 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 
613 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
676 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  40.68 
 
 
598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 
646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
676 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  41.64 
 
 
665 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  42.9 
 
 
607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  43.06 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  42.23 
 
 
676 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  41.71 
 
 
678 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 
617 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  41.05 
 
 
617 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 
616 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  44.13 
 
 
690 aa  467  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  465  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  41.76 
 
 
649 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  42.01 
 
 
594 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  40.47 
 
 
636 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 
610 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  42.83 
 
 
684 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  42.33 
 
 
594 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  42.28 
 
 
596 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  42.81 
 
 
644 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  41.49 
 
 
604 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  41.01 
 
 
641 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  41.28 
 
 
692 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  40.65 
 
 
693 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  42.83 
 
 
591 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  43.13 
 
 
629 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  41.17 
 
 
643 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  40.75 
 
 
675 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  40.1 
 
 
628 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  41.36 
 
 
622 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  42.83 
 
 
647 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  39.34 
 
 
647 aa  453  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  40.69 
 
 
678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.28 
 
 
613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  41.03 
 
 
626 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  40.6 
 
 
640 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  39.46 
 
 
627 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  39.58 
 
 
599 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  40.44 
 
 
628 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  40.92 
 
 
649 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  41.6 
 
 
591 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 
623 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  39.57 
 
 
679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  39.87 
 
 
640 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  39.39 
 
 
612 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  41.18 
 
 
624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  38.5 
 
 
613 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  42.81 
 
 
610 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  42.72 
 
 
627 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  41.24 
 
 
663 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>