125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3951 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  68.64 
 
 
169 aa  258  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  57.67 
 
 
168 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  42.95 
 
 
160 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  40.45 
 
 
178 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  40.48 
 
 
171 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  35.75 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  43.04 
 
 
160 aa  127  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  32.19 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  38.71 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.01 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  34.81 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  34.67 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  35.86 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  32.21 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  32.21 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.19 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  31.97 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.21 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.89 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  33 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  33 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.93 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  29.93 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  31.21 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  26.36 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  29.06 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.97 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  29.75 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  31.82 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  28.29 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.26 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  35.29 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  26.58 
 
 
188 aa  60.8  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  27.72 
 
 
188 aa  60.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
189 aa  60.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  30.77 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  28 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  27.56 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 
215 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.62 
 
 
180 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  31.25 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.97 
 
 
192 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  32.79 
 
 
180 aa  58.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.55 
 
 
190 aa  58.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  27.2 
 
 
200 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 
190 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.71 
 
 
197 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 
225 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  27.89 
 
 
192 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.55 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.32 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  28.87 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.25 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0615  hypothetical protein  27.61 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0918214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.36 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  31.31 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.03 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  29.09 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.81 
 
 
190 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  30.21 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  31.43 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  29.91 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  28.1 
 
 
205 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  26.72 
 
 
194 aa  53.9  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.64 
 
 
176 aa  53.9  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  24.85 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  23.01 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  28.21 
 
 
216 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  26.83 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
186 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  34.92 
 
 
160 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  28.3 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.78 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.1 
 
 
123 aa  51.2  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.46 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.68 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  23.97 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  30.6 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.89 
 
 
185 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  25.35 
 
 
202 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.51 
 
 
203 aa  47.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 
194 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  22.69 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  25.3 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  27.68 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  23.02 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>