More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3933 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  74.18 
 
 
428 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  100 
 
 
426 aa  856    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  74.71 
 
 
430 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  74.71 
 
 
430 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  72.83 
 
 
430 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  75.29 
 
 
428 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  79.53 
 
 
428 aa  692    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  77.18 
 
 
427 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  73.24 
 
 
429 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  73.46 
 
 
425 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  75.82 
 
 
429 aa  667    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  73.07 
 
 
428 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  73.24 
 
 
429 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  71.43 
 
 
429 aa  628  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  71.73 
 
 
431 aa  627  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  71.6 
 
 
428 aa  625  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  625  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  71.83 
 
 
429 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  71.83 
 
 
429 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  72.2 
 
 
431 aa  617  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  72.2 
 
 
431 aa  617  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 
431 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  70.45 
 
 
431 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  72.01 
 
 
425 aa  617  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  71.73 
 
 
431 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  71.36 
 
 
429 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
431 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1403  phosphopyruvate hydratase  72.3 
 
 
434 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000162747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  68.85 
 
 
427 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  69.86 
 
 
431 aa  609  1e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  72.64 
 
 
433 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  70.56 
 
 
431 aa  607  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2254  phosphopyruvate hydratase  71.7 
 
 
431 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0274446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  69.84 
 
 
435 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  69.46 
 
 
432 aa  595  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0446  phosphopyruvate hydratase  67.13 
 
 
434 aa  588  1e-167  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
434 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 
434 aa  588  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0358  enolase  68.85 
 
 
429 aa  588  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.82 
 
 
427 aa  588  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 
427 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 
426 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 
425 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  67.3 
 
 
425 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 
429 aa  584  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  69.36 
 
 
433 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
425 aa  585  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 
426 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  67.3 
 
 
425 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  69.43 
 
 
426 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  67.53 
 
 
427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  68.71 
 
 
429 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  69.32 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  65.18 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0341  phosphopyruvate hydratase  65.58 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00111686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  70.73 
 
 
427 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  69.32 
 
 
429 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  67.77 
 
 
427 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  67.87 
 
 
422 aa  579  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  69.32 
 
 
429 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 
426 aa  578  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  68.74 
 
 
428 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  67.14 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  68.97 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  68.74 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.02 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 
428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  66.51 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  66.51 
 
 
432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  69.32 
 
 
429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 
428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 
424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 
427 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  65.63 
 
 
423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 
425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  65.02 
 
 
430 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.65 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0074  phosphopyruvate hydratase  68.25 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00475517  unclonable  0.00000000106415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>