63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3922 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  882    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0853  ATPase  23.98 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  31.3 
 
 
976 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  24.94 
 
 
427 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  41.11 
 
 
336 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  45.31 
 
 
368 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0629  AAA ATPase  31.91 
 
 
446 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0181  ATPase  27.13 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.269249  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  32 
 
 
450 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1645  ATPase  30.48 
 
 
451 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  35.8 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0945  ATPase  36.71 
 
 
448 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  27.08 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  36.23 
 
 
454 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1859  hypothetical protein  39.74 
 
 
464 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  27.78 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  32.56 
 
 
672 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  33.33 
 
 
533 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  20.23 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2114  ABC transporter related  32.14 
 
 
504 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  34.72 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  29.82 
 
 
670 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  31.94 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  26.67 
 
 
495 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  30.77 
 
 
584 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  39.24 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  32.43 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  35.62 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2378  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
229 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.514207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  35.14 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  27.91 
 
 
421 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  26.67 
 
 
556 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  32.28 
 
 
369 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  29.82 
 
 
461 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
494 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  33.62 
 
 
530 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  31.9 
 
 
599 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  34.88 
 
 
516 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  28.04 
 
 
267 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
530 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  31.9 
 
 
555 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
530 aa  43.9  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  44.44 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  36.92 
 
 
666 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0076  ABC transporter related  30.56 
 
 
507 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
555 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
254 aa  43.5  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  34.72 
 
 
221 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 
531 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  55.26 
 
 
496 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1490  ABC transporter related  33.71 
 
 
408 aa  43.1  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  30.56 
 
 
530 aa  43.1  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  34.43 
 
 
523 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  26.19 
 
 
238 aa  43.1  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  33.33 
 
 
619 aa  43.1  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
667 aa  43.1  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  35.29 
 
 
708 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>