More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3816 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  35.92 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  34.75 
 
 		 140 aa  84.3  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  34.97 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  34.97 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  34.97 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  34.97 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  34.97 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  34.97 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  34.27 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  34.27 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  32.03 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  33.57 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.14 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.56 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.56 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.86 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  32.65 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3480  UspA domain protein  28 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  33.11 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.03 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.64 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  33.11 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  33.57 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  33.1 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.41 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.94 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  29.25 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  27.03 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  29.58 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  30.28 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.76 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  29.87 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1559  UspA domain protein  31.29 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.411505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  30.77 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.08 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  28.26 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  28.1 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.94 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.78 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.73 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  28.38 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.86 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.21 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.64 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  28.38 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  26.43 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.38 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  34.44 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  27.14 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2521  hypothetical protein  26.76 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  30.61 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  32.39 
 
 		 287 aa  60.5  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  28.67 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  30.41 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3020  putative universal stress protein Usp  25.9 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.680778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.13 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.37 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.14 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  27.66 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  28.68 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>