91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3686 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3686  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 133 aa  269  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0622  transcriptional regulator, putative  42.19 
 
 		 303 aa  50.8  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.436499  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2375  hypothetical protein  48.48 
 
 		 220 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7073  transcriptional regulator  28.68 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  33.75 
 
 		 308 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0147  hypothetical protein  42.42 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  37.66 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  42.42 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 349 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  37.88 
 
 		 303 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1039  XRE family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000101655  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  39.34 
 
 		 302 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0508  transcriptional regulator, putative  35.82 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  35.53 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  35.38 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1248  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000139831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2142  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 347 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19180  predicted transcriptional regulator  34.38 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.433834  normal  0.0717748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4125  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.893479  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1248  DNA-binding protein  25.19 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.821781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3830  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0176274  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4027  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.571082  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  37.1 
 
 		 214 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  36.36 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3193  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.324962  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3148  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1389  transcriptional regulator, XRE family  28.17 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  45 
 
 		 209 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4050  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 307 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4140  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 307 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  25.2 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2653  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0200481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.86 
 
 		 267 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3893  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 107 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  32.74 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3505  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.15 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  30.63 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1815  XRE family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0843474  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  40 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  34.15 
 
 		 233 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0791  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 214 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3926  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 127 aa  40.8  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1892  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0540  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0675  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00325967 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1249  Cro/CI family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1242  helix-turn-helix domain protein  34 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.471276  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.15 
 
 		 233 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 179 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6504  transcriptional regulator, XRE family  26.56 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9124  hypothetical protein  30.38 
 
 		 241 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 101 aa  40  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  35.06 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  35.06 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0067  hypothetical protein  48.65 
 
 		 240 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4530  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 152 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 126 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 113 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  39.39 
 
 		 113 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>