55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3666 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  100 
 
 
337 aa  693    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  52.74 
 
 
429 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  39.51 
 
 
483 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  35.22 
 
 
423 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  35.99 
 
 
434 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  34.93 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  34.63 
 
 
437 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  33.97 
 
 
466 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  31.46 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  27.82 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  29.06 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  28.57 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.42 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  30.45 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  26.57 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  26.14 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  26.14 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.05 
 
 
388 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.67 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  26.67 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.47 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  26.67 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  27.16 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  27.16 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1305  hypothetical protein  23.69 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.17 
 
 
389 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  26.52 
 
 
385 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  25.44 
 
 
385 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.29 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  27.23 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  25.68 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.38 
 
 
389 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.26 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  25.89 
 
 
386 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  24.87 
 
 
383 aa  52.8  0.000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  24.74 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.67 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  23.47 
 
 
435 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  24.83 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  23.43 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.6 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  24.08 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  27.64 
 
 
469 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  23.92 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  22.88 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  22.73 
 
 
393 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  22.86 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  22.86 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  22.55 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.24 
 
 
373 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  24.14 
 
 
661 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  24.14 
 
 
661 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  21.58 
 
 
439 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  20.71 
 
 
411 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>