More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3662 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  100 
 
 		 389 aa  806    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  39.5 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  38.17 
 
 		 370 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  35.35 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  35.06 
 
 		 381 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.29 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30.29 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  32.9 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  31.25 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  31.23 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  32.69 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.65 
 
 		 435 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  32.15 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  31.38 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  29.6 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.39 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  33.88 
 
 		 377 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  30.05 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  32.1 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  30.69 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.52 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  30.32 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  30.65 
 
 		 363 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.78 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  29.69 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.28 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.33 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  30.16 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.93 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.84 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  30.51 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.68 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.3 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  29.78 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  28.81 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.8 
 
 		 357 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.61 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  26.24 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  30.86 
 
 		 384 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.45 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.7 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.13 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  26.57 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  27.67 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.8 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.42 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.05 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.72 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  26.17 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 386 aa  133  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.15 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.54 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  27.75 
 
 		 656 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.9 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.9 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  30.17 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.04 
 
 		 376 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.33 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.84 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.51 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  26.88 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  27.2 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  25 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.74 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.96 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  27.05 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.94 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.71 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.58 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  32.28 
 
 		 201 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  26.29 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.43 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.46 
 
 		 437 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 471 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.09 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  27.16 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.99 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.27 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.75 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  27.22 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  25.97 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.13 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  27.3 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  25.73 
 
 		 492 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  25.44 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  22.88 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.06 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.34 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>