154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3646 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
343 aa  707    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  88.05 
 
 
343 aa  619  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  77.55 
 
 
343 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.02 
 
 
343 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  57.14 
 
 
342 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  55.1 
 
 
343 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1007  CRISPR-associated Cas1 family protein  54.23 
 
 
343 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  53.49 
 
 
344 aa  374  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  51.02 
 
 
343 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  50.44 
 
 
343 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.15 
 
 
343 aa  362  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 
346 aa  358  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  51.9 
 
 
343 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 
343 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  50.29 
 
 
346 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1976  CRISPR-associated protein Cas1  51.9 
 
 
343 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  52.45 
 
 
344 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  50.43 
 
 
344 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  49.42 
 
 
344 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  46.65 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  44.61 
 
 
341 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  43.7 
 
 
339 aa  295  9e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  43.7 
 
 
339 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.15 
 
 
343 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.99 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.44 
 
 
343 aa  285  7e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  41.57 
 
 
344 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.98 
 
 
342 aa  275  8e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  43.15 
 
 
344 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  37.54 
 
 
346 aa  245  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.32 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  37.39 
 
 
598 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  34.71 
 
 
333 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3346  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.81 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0114588  normal  0.257048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  34.12 
 
 
545 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.19 
 
 
339 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.63 
 
 
559 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.03 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  32.14 
 
 
550 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3451  CRISPR-associated protein Cas1  35.65 
 
 
339 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  0.143241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.73 
 
 
570 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  32.06 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  34.52 
 
 
594 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
553 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.64 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.55 
 
 
544 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  33.57 
 
 
580 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  30.59 
 
 
325 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  30.84 
 
 
325 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  30.54 
 
 
325 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  32.37 
 
 
525 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.77 
 
 
347 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.99 
 
 
330 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  32.16 
 
 
331 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  32.06 
 
 
334 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.35 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  30.32 
 
 
731 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  27.86 
 
 
325 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1749  hypothetical protein  31.88 
 
 
336 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.98 
 
 
350 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.03 
 
 
731 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  30.25 
 
 
727 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1634  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.22 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  30.33 
 
 
329 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2061  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.71 
 
 
347 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1154  hypothetical protein  32.29 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00923322  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0151  CRISPR-associated protein Cas1  27.54 
 
 
336 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.855005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1870  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.07 
 
 
337 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12831  hypothetical protein  29.25 
 
 
338 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00550704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3303  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.81 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.597515  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  26.76 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  26.4 
 
 
558 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  29.64 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  26.06 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2676  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.82 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.88 
 
 
331 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0224  CRISPR-associated protein Cas1  26.63 
 
 
323 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.868233 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  26.26 
 
 
330 aa  115  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3012  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.65 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0160933  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5081  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.09 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1767  CRISPR-associated protein Cas1  27.49 
 
 
336 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  23.44 
 
 
330 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0708  CRISPR-associated protein Cas1  26.11 
 
 
323 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000161833  hitchhiker  0.00702489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0619  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.47 
 
 
320 aa  105  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0887113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.08 
 
 
333 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
330 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.86 
 
 
331 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.42 
 
 
330 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.59 
 
 
330 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  24.24 
 
 
331 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.32 
 
 
329 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  24.6 
 
 
330 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.08 
 
 
342 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0567  CRISPR-associated protein Cas1  26.67 
 
 
337 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.424472  normal  0.165251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.17 
 
 
321 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.9 
 
 
327 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  24.82 
 
 
330 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  23.89 
 
 
331 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0229  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.26 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.583054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  24.27 
 
 
326 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>