22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3615 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3615  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 393 aa  800    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0892578  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0040  putative transmembrane anti-sigma factor  34.27 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.411333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  30.14 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0844  putative transmembrane anti-sigma factor  32.93 
 
 		 146 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000720688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0580  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.58 
 
 		 267 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4156  putative transmembrane anti-sigma factor  33.78 
 
 		 366 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0909715  hitchhiker  0.000583924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0273  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 135 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287292  normal  0.724459 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1326  hypothetical protein  37.21 
 
 		 465 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000243968  hitchhiker  0.00621187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  31.94 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1761  putative transmembrane anti-sigma factor  23.81 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2922  anti-sigma factor  34.48 
 
 		 88 aa  47.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0889  putative transmembrane anti-sigma factor  29.41 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0058  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 223 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0539  anti-sigma factor  43.75 
 
 		 90 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0049  hypothetical protein  34.55 
 
 		 88 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.667349  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0599  hypothetical protein  35.19 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3707  anti-sigma factor  29.76 
 
 		 99 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.397334  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  24.05 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8323  hypothetical protein  36.73 
 
 		 88 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2018  putative transmembrane anti-sigma factor  29.35 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2650  hypothetical protein  37.04 
 
 		 86 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3810  hypothetical protein  34.92 
 
 		 81 aa  42.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>