37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3578 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 
146 aa  305  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  80.82 
 
 
147 aa  258  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  75.89 
 
 
145 aa  227  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  71.23 
 
 
147 aa  221  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  68.71 
 
 
147 aa  213  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  61.64 
 
 
140 aa  192  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  60.96 
 
 
140 aa  189  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  65.41 
 
 
162 aa  188  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 
167 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  59.59 
 
 
140 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 
167 aa  186  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 
144 aa  186  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.16 
 
 
162 aa  184  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.64 
 
 
167 aa  184  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  61.65 
 
 
162 aa  179  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  59.46 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.07 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  43.15 
 
 
160 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.78 
 
 
160 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  40.82 
 
 
160 aa  104  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.95 
 
 
161 aa  102  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  42.42 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37 
 
 
114 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.05 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  35.24 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.64 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.95 
 
 
105 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  36.51 
 
 
396 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0999  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 
658 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  40.32 
 
 
60 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.3 
 
 
642 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  27.18 
 
 
500 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.7 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
588 aa  40  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>