201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3532 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  100 
 
 		 158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  54.84 
 
 		 165 aa  175  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  53.9 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.56 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  54.43 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  55.48 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  55.48 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  55.48 
 
 		 168 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  54.19 
 
 		 166 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  52.9 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  52.26 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  51.61 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  50.33 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  53.5 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50.32 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  54.84 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  55.48 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  53.55 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  54.79 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  50.97 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  49.67 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  52.9 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  53.21 
 
 		 165 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  49.67 
 
 		 166 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.74 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  52.26 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  52.74 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  50.97 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  51.61 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  53.9 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  52.9 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  50.32 
 
 		 165 aa  153  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  49.68 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  51.61 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  48.39 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  54.19 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  51.61 
 
 		 165 aa  151  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50.32 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  48.72 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  47.74 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  50.97 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.79 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  52.03 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.86 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  44.44 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  44.16 
 
 		 166 aa  137  6e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  44.3 
 
 		 169 aa  137  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  50.97 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.35 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  41.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  42.04 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  42.04 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  38.6 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  38.01 
 
 		 184 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.43 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  35.67 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  38.37 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  41.4 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.21 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  50.97 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  38.55 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  42.11 
 
 		 202 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  41.52 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  40.94 
 
 		 202 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  41.4 
 
 		 228 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  37.79 
 
 		 263 aa  108  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  39.38 
 
 		 184 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40.38 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  35.5 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  50 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  39.18 
 
 		 200 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.38 
 
 		 233 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  40 
 
 		 179 aa  94  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  38.89 
 
 		 392 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  36.48 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  38.6 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  38.22 
 
 		 221 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  44 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.74 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  35.09 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  39.33 
 
 		 177 aa  89.4  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  32.87 
 
 		 243 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0568  Rubrerythrin  32.18 
 
 		 179 aa  89  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  44.35 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  45 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.94 
 
 		 235 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.9 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  39.74 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  37.04 
 
 		 181 aa  88.2  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  38.92 
 
 		 215 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  38.32 
 
 		 183 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  39.74 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  37.72 
 
 		 216 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  38.32 
 
 		 183 aa  87.4  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  35.85 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  41.41 
 
 		 143 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  38.32 
 
 		 183 aa  87.4  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  41.03 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  41.03 
 
 		 179 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>