More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3336 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
661 aa  1358    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  54.65 
 
 
658 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  49.16 
 
 
655 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  47.83 
 
 
646 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  40.27 
 
 
703 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  41.46 
 
 
689 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 
643 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  36.27 
 
 
697 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.97 
 
 
645 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 
639 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 
647 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
636 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  35.17 
 
 
625 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.61 
 
 
761 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.84 
 
 
642 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 
645 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  35.32 
 
 
724 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
636 aa  342  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
609 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 
646 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 
640 aa  332  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  35.52 
 
 
701 aa  332  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
634 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 
671 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  33.03 
 
 
681 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
640 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 
697 aa  323  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 
709 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 
670 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.34 
 
 
619 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.67 
 
 
800 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  31.66 
 
 
667 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  32.78 
 
 
716 aa  317  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  32.43 
 
 
610 aa  316  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 
646 aa  316  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  31.21 
 
 
802 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.91 
 
 
809 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.91 
 
 
803 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.2 
 
 
611 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 
802 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 
802 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 
802 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  31.06 
 
 
802 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 
767 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.77 
 
 
803 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 
771 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 
635 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  32.62 
 
 
644 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
646 aa  306  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  30.14 
 
 
801 aa  306  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.69 
 
 
633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 
793 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  31.05 
 
 
618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 
766 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 
647 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  33.76 
 
 
596 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.18 
 
 
641 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 
686 aa  303  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
600 aa  303  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
619 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 
635 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  30.25 
 
 
801 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 
618 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.92 
 
 
618 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 
618 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
618 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
618 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 
618 aa  299  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  29.2 
 
 
637 aa  299  9e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
801 aa  299  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 
631 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  29.73 
 
 
631 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  30.35 
 
 
708 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
618 aa  297  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 
610 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
623 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 
631 aa  296  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 
631 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
605 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.27 
 
 
629 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
623 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
623 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.79 
 
 
629 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 
629 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 
623 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
634 aa  293  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
628 aa  293  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  30.47 
 
 
623 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.87 
 
 
641 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  30.52 
 
 
629 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 
613 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
602 aa  291  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  29.29 
 
 
632 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 
627 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 
629 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  30.22 
 
 
629 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 
641 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>