More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3332 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 
380 aa  766  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  59.32 
 
 
388 aa  466  1e-130  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  55.83 
 
 
412 aa  452  1e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  57.14 
 
 
377 aa  443  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  56.92 
 
 
378 aa  415  1e-115  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.11075e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  51.55 
 
 
387 aa  362  6e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.24977e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  46.84 
 
 
378 aa  357  1e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  45.36 
 
 
365 aa  330  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  41.53 
 
 
379 aa  307  2e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  44.13 
 
 
372 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  45.21 
 
 
366 aa  282  6e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  42.23 
 
 
369 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  43.62 
 
 
366 aa  276  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  43.47 
 
 
365 aa  274  2e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  42.33 
 
 
366 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  44.56 
 
 
366 aa  273  4e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  40.55 
 
 
421 aa  269  5e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  40.19 
 
 
419 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  44.5 
 
 
366 aa  266  6e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  44.5 
 
 
366 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  40.6 
 
 
365 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  41.69 
 
 
367 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  40.7 
 
 
373 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  39.78 
 
 
367 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  39.3 
 
 
374 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  41.5 
 
 
417 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 
417 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  41.78 
 
 
417 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  41.18 
 
 
366 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  40.69 
 
 
363 aa  254  2e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  39.3 
 
 
374 aa  253  5e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  41.95 
 
 
401 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  38.65 
 
 
426 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  247  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  39.25 
 
 
369 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 
368 aa  245  1e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  1.62732e-09 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  38.5 
 
 
364 aa  244  2e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  38.48 
 
 
403 aa  244  2e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  39.67 
 
 
367 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  37.3 
 
 
368 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1565  cell division protein FtsW  40.65 
 
 
364 aa  243  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
367 aa  242  8e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.70795e-05  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
367 aa  242  8e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  40.27 
 
 
413 aa  242  8e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  35.36 
 
 
367 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  37.1 
 
 
371 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  39.78 
 
 
364 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  4.70166e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.82573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  37.57 
 
 
368 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  39.57 
 
 
372 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  36.86 
 
 
371 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  39.3 
 
 
368 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.78779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  40.23 
 
 
368 aa  239  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  38.1 
 
 
390 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  41.64 
 
 
387 aa  239  6e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  35.43 
 
 
374 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  36.44 
 
 
376 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  39.73 
 
 
374 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  37.9 
 
 
382 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  41.95 
 
 
368 aa  236  5e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  39.41 
 
 
382 aa  235  1e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 
368 aa  234  2e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.43295e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  40.49 
 
 
373 aa  234  2e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 
371 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.63 
 
 
373 aa  232  6e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.47199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  40.38 
 
 
368 aa  232  7e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.82729e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 
371 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0975  stage V sporulation protein E  37.94 
 
 
383 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.01202e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  39.95 
 
 
368 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  38.13 
 
 
386 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  38.62 
 
 
377 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  43.88 
 
 
384 aa  229  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  35.05 
 
 
365 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0825  cell cycle protein  38.29 
 
 
364 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0999607  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  38.67 
 
 
423 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  37.37 
 
 
376 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 
373 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.58 
 
 
366 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  38.87 
 
 
373 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  44.22 
 
 
371 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  37.93 
 
 
373 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2103  cell cycle protein FtsW  37.43 
 
 
374 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  3.19192e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.33 
 
 
372 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  37.64 
 
 
359 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  38.14 
 
 
372 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2391  cell cycle protein FtsW  37.7 
 
 
374 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00202721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  39.4 
 
 
368 aa  226  5e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  38.26 
 
 
422 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  37.44 
 
 
422 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  36.68 
 
 
398 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  35.95 
 
 
371 aa  226  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  39.65 
 
 
376 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06110  rod shape-determining protein RodA  37.03 
 
 
404 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.23269e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 
383 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  37.2 
 
 
370 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  37.47 
 
 
370 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.42 
 
 
412 aa  223  5e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  35.98 
 
 
378 aa  222  7e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>